В ночь с 16 на 17 июля 1918 года было совершено убийство семьи Николая II — последнего Государя Российской империи, а в ночь с 24 на 25 июля Екатеринбург был занят войсками Колчака. Отход красных проходил довольно стремительно, о чём свидетельствует тот факт, что комендант "дома особого назначения", где содержалась перед убийством царская семья, Яков Юровский, уезжая вечером 19 июля, забыл на столе в своей комнате собственный бумажник с 2000 руб.
30 июля Колчаком была назначена следственная комиссия, её возглавил следователь А. Намёткин. Через неделю исполняющий обязанности прокурора Екатеринбургского окружного суда Кутузов, считая, что Намёткин ведёт дело неэнергично, передаёт его в руки молодого следователя И.А. Сергеева. 4 января 1919 года прокурор предложил Сергееву изъять из Екатеринбургской телеграфной конторы все подлинные телеграммы большевиков. Таким образом, в руках следствия оказались шифровки телеграмм переписки Уралсовета с Москвой. В начале февраля 1919 года следствие было передано Н.А. Соколову — следователю по особо важным делам. Генерал М.К. Дитерихс, начальник штаба Чехословацкого корпуса, курировавший расследование убийства царской семьи, характеризовал Соколова как чрезвычайно энергичного и талантливого следователя.
Действительно, когда в конце 80-х годов в Советском Союзе в самиздате появились материалы "Предварительного следствия, произведённого судебным следователем по особо важным делам Н.А. Соколовым по делу об убийстве отрёкшегося от Престола Российского Государства Государя Императора Николая Александровича…", многие были поражены дотошностью следствия. Был охвачен огромный круг свидетелей, включая и тех, кто находился внутри Ипатьевского дома, и тех, кто имел хоть какое-то отношение к "дому особого назначения". Все комнаты дома Ипатьевых были детально описаны. Таким же образом поработала комиссия на месте сожжения тел у Ганиной ямы, где употреблялось даже просеивание земли.