Эти противоречия привели в итоге к настоящей гражданской войне, в которой Иван Грозный и созданные им войска опричников топили в крови все, что могло бы поставить под угрозу "проект Третьего Рима" на века вперед. Цель была достигнута ценой колоссальных людских потерь и опустошения некогда процветающих земель. Однако когда тридцать лет спустя на Россию обрушилось нашествие с Запада, идея единого, общего для всех Отечества стала мощнейшим стимулом патриотического сопротивления, закончившегося взятием Кремля ополченцами Минина и Пожарского 6-7 ноября 1612 года.
Катастрофа 1237 года не повторилась, и энергия национального подъема помогла России справиться и с польско-литовскими интервентами, и с претензиями на власть уцелевших в годы опричины феодалов, "семибоярщины". Справившись со смутой, Россия вступила в XVII век, когда русские землепроходцы вышли к Тихому океану, а контуры страны приобрели очертания, более или менее приближенные к современным.
Параллельно процессу роста российской государственной территории усиливалась централизация управленческой системы. При Петре I, превратившем страну в огромный военно-промышленный лагерь, происходит окончательный отказ от хаотичного, унаследованного от прежних эпох административного деления. Основной административной единицей в Московском Царстве был уезд, то есть какой-то город с прилегающими к нему землями. Уезды могли на порядок отличаться друг от друга по своей территории и численности населения, включая в себя то территорию бывших княжеств, то их отдельные, небольшие части. В 1708 году Петр I издал указ о создании 8 губерний (Московской, Ингерманландской (Петербургской), Смоленской, Киевской, Архангелогородской, Казанской, Азовской и Сибирской).
Петровские губернии были одновременно и прообразом современных военных округов. Сами губернаторы соединяли в одном лице военную, административную и судебную власти, сконцентрировав в своих руках такие полномочия, которые даже не снились воеводам времен Московского Царства.
В 1719 году число губерний было доведено до 11, а сами губернии были разделены на провинции, отдаленные прообразы нынешних "субъектов РФ". Так, к примеру, Московская губерния включала в себя Костромскую, Владимирскую, собственно Московскую провинцию и т.д. В 1775 году новую реформу государственного устройства провела Екатерина II, в ходе которой провинции были преобразованы в 40 губерний, однако поверх них возникли генерал-губернаторства, объединявшие по нескольку губерний вместе. Генерал-губернаторы, в свою очередь, выполняли, как бы сейчас сказали, контрольно-надзорные функции, а также руководили силовыми структурами, например, командовали полицией. Подобная структура административно-территориального устройства просуществовала, хотя и в существенно видоизмененном виде, до 1917 года.
После падения монархии на руинах империи возникло несколько десятков самостоятельных государств и государственных образований, со своими правительствами, армиями и даже денежными знаками. Казалось, что России грозит неминуемый распад, однако победа большевиков позволила восстановить государственное единство в границах, немногим отличавшихся от имперских границ 1914 года. Вместе с тем вернуться к прежней модели государственного устройства было уже невозможно: белогвардейцы, поднявшие на щит лозунг "Единой и Неделимой", были вынуждены вести борьбу не только со своими главными противниками, но и с петлюровской "директорией", казахской Алаш-Ордой, грузинскими меньшевиками, а также кавказскими горцами. Даже коммунисты на национальных окраинах были готовы присоединиться к "земшарной республике Советов", но вовсе не хотели снова оказаться в составе России. В то время Сталин, отвечавший за национальную политику, был готов проигнорировать требования "национал-уклонистов", соглашаясь лишь на автономию Украины и Закавказья в рамках РСФСР. Возможно, что если бы это ему удалось, то, несмотря ни на какие "перестройки", мы жили бы сегодня в другой стране. Миллионы русских не страдали от гнета новоявленных "ханов", не знали бы войны Карабах, Абхазия, Приднестровье, Чечня. Однако Сталина не поддержали товарищи по партии, считавшие Россию "тюрьмой народов" и обвинявшие его в "великорусском шовинизме". В итоге возобладала другая, "романтическая" точка зрения, что привело к созданию Союза советских республик, двери которого оставались открытыми для "революционного пролетариата" Германии, Венгрии, Болгарии и т.д.
Когда же стало окончательно ясно, что "мировая революция" не состоится, Сталин практически довел до конца свой "план автономизации", предоставив союзным республикам лишь ограниченное самоуправление. Еще более жестким был контроль за автономиями в составе РСФСР, которые в то время создавались даже для самых немногочисленных этнических групп.