После того как «Организация» перешла в ведение Федерального правительства, Гелен получил распоряжение прекратить засылку шпионов в СССР с моря и воздуха. Будучи членом НАТО, ФРГ не желала осложнять отношения с Москвой; любой крупный скандал был бы русским только на руку, давая пищу для еще более ожесточенной пропаганды против членов Североатлантического союза. Правда, запрет этот не распространялся на засылку агентов с воздуха и моря на территорию Восточной Германии. В 1966 году восточногерманское Министерство госбезопасности опубликовало перечень случаев нарушения воздушного пространства страны в период с 1960 по 1965 год. Всего якобы имели место 65 подобных инцидентов, «во время которых на территорию ГДР забрасывались шпионы, диверсанты и пропагандистские материалы. Приводятся даже данные о моделях используемых для этого самолетов, таких как американские боевые машины Т-39, RB-66 и F-84, состоявшие на вооружении бундесвера. Но даже если предположить, что эти цифры верны, то окажется, что с воздуха сбрасывалось агентов не так уж и много по сравнению с тем же их количеством, что проникало в страну по суше.
В 1958 году Гелен сумел вернуть англичанам долг за их помощь в организации засылки агентов с моря. Случилось так, что один немецкий офицер, проходивший курс подготовки в спецшколе НАТО в Великобритании, оказался советским шпионом. Гелен отправил срочное донесение тогдашнему главе СИС сэру Дику Уайту и директору Объединенного бюро разведки при Министерстве обороны Великобритании генерал-майору сэру Кеннету Стронгу, в котором предупреждал, что этот шпион уже, возможно, передал секретным агентам русских в Лондоне имевшуюся у него информацию.
На тот момент этот офицер, Хорст Гейнц Людвиг, все еще находился на базе в Шотландии. Его сообщники в Германии уже были арестованы, но сам он еще об этом даже не догадывался. Чтобы вернуть Людвига в Германию, командир приказал ему на какое-то время вернуться домой якобы для согласования его дальнейшего назначения. Британские спецслужбы окутали все это дело покровом тайны. Во время суда над Людвигом, который состоялся в январе 1960 года в Карлсруэ, лишь немногие подробности стали достоянием гласности. Слушание проходило за закрытыми дверями, на процессе присутствовали представители американской и британской разведок. На момент суда Людвигу было всего лишь 34 года. Свою военную карьеру он начинал юным призывником гитлеровского вермахта незадолго до окончания войны. Освободившись из американского лагеря для военнопленных, он приехал к родителям в советскую оккупационную зону и в 1947 году поступил на инженерный факультет Йенского университета, который окончил в 1950 году. Через год он бежал в Западную Германию, где устроился на работу к американцам в специальное подразделение, занимавшееся разминированием порта Бремерхафена. Там он познакомился и подружился с Фрицем Бриземайером, бывшим младшим морским офицером. В 1955 году Людвиг подал прошение о зачислении в ряды недавно созданного бундесвера, получил офицерское звание и прошел курс начальной летной подготовки. По соглашению между Бонном и Вашингтоном многие офицеры бундесвера направлялись проходить курс дальнейшей подготовки в США. Так Людвиг попал на базу ВВС США в Пенсаколе, штат Флорида, где провел два года.
Как-то раз, пытаясь совершить посадку на палубу авианосца, он рухнул в море, получив серьезные травмы. Правда, вскоре оправился и вернулся в Германию, где продолжил службу в авиационных частях, обслуживавших военно-морской флот. Людвиг быстро пошел вверх по служебной лестнице и в начале лета 1958 года получил назначение на учебные курсы на базу Королевского военно-морского флота в Шотландии. Предполагалось, что там он улучшит свое летное мастерство согласно разработанной руководством НАТО схеме: сначала будет летать на истребителе «Си Виксен», а затем пройдет курс обучения на новом английском всепогодном морском истребителе «Симитар», в ту пору еще засекреченном. Предполагалось, что эти боевые машины будут официально взяты на вооружение лишь к концу года. Людвиг успешно прошел все натовские проверки и на базе имел доступ ко всем секретным материалам и руководствам по эксплуатации нового самолета.