Годовое количество осадков в юго-восточной части предгорий 600–800 мм (северный макросклон ГКХ), на южном макросклоне 800–1000 мм. Засухи в летнее время сравнительно редки и непродолжительны. Зима очень короткая и мягкая. Выпавший снег, как правило, быстро тает.
Климатические условия в горах различаются. Уже в сентябре в высокогорье выпадает первый снег, который через несколько дней тает. Устойчивый снежный покров устанавливается с конца ноября – начала декабря и держится до апреля. В районе Красной Поляны (метеостанция Ачишхо) расположено самое влажное место в России. Здесь выпадает свыше 3200 мм осадков в год. Глубина снежного покрова в многоснежные зимы достигает 7–8 м.
В северной части побережья (у Анапы) климат континентальный. Лето жаркое, местность продувается ветрами, поэтому зной не ощущается. Годовое количество осадков не превышает 420 мм. Зима теплая. Анапе принадлежит пальма первенства в номинации «Самый солнечный город Черноморского побережья»: 2460 часов в году. Южный Причерноморский район – это типично влажные субтропики. С севера Главный Водораздел защищает его от холодных ветров. С другой стороны, теплое море обогревает его. Несмотря на большое количество осадков (1300–1400 мм в год), солнечная погода – частый гость в Сочинском районе.
Речная система Краснодарского края состоит из рек Азово-Кубанской низменности, реки Кубани и ее притоков, а также причерноморского бассейна. Она насчитывает более 13 тысяч рек, речек и ручьев. Речные долины степей Кубани и плавней Приазовья широкие с пологими берегами. Спокойное течение рек придает им незначительные уклоны. Почти все реки текут с юго-востока на северо-запад и впадают в Азовское море. Самый крупный водоток – река Ея (протяженность 311 км, площадь водосборного бассейна 8650 км2), впадающая у станицы Старощербиновской в Ейский лиман. Реки Азово-Кубанской низменности имеют рекреационное значение. В них ловят рыбу, купаются, по берегам некоторых рек строят базы отдыха. Развита сезонная охота на водоплавающих.
К бассейну Кубани относятся непосредственно сам водоток и его левые притоки. Река Кубань – главная водная артерия края – имеет протяженность 870 км при площади водосбора 57900 км2. В верховьях это типично горная река, стремительная и говорливая; в среднем и нижнем течениях она глубокая и широкая, спокойная и величественная. Река судоходна, почти все притоки Кубани левые. Самый длинный и водоносный приток – река Лаба (вместе с Большой Лабой – протяженность 341 км, площадь бассейна 12500 км2). Крупными являются также притоки 1-го порядка: Уруп, Белая, Пшиш, Псекупс (впадают в Краснодарское водохранилище), Афипс (в Шапшугское водохранилище).
Западнее Афипса в реку Кубань впадают свыше двух десятков рек, некоторые из них летом пересыхают.
Реки Черноморья отличаются большими уклонами и часто имеют вид горных ручьев. Русла их каменистые или галечниковые. В верхнем течении многих рек долины имеют ущелье– или каньонообразный характер. От Новороссийска до юго-восточной границы насчитывается до 80 рек, впадающих в море. И только 3 из них – Мзымта, Шахе и Псоу – имеют протяженность свыше 50 км и площадь водосбора больше 400 квадратных км.
Озера всегда привлекали к себе неповторимой красотой, чистым воздухом, царящими на их берегах тишиной и спокойствием. Озера есть в Краснодарском крае как вдоль берегов Азова и Черного моря (Ханское, Голубицкое, Соленое, Чембурка), так и в долинах степных рек. Особо выделяются горные озера. Как говорит известный знаток озер Кавказа, доктор географических наук Ю. В. Ефремов: «Пожалуй, нигде в другом месте не дышится так легко и свободно, как на берегах высокогорных озер. И нигде больше не встретишь такого согласия между водой и небом, горами и землей». Самое большое пресноводное озеро в крае – озеро Абрау, расположенное на высоте 84 м. Его площадь 1,6 км2. Чемпионом красоты считается высокогорное озеро Кардывач, окруженное скальными бастионами 3-километровых вершин. Много неразгаданного таят в себе озера-карлики – Хыжи (святое у адыгов, Туапсинский район), Верхнеафипские Лох-Несси (Северский район), Мертвое (Горячеключевской район) и многие другие.
Один мудрый человек сказал: «Не надоедает никогда смотреть на три вещи: лицо любимой женщины, пылающий костер и падающую с уступа воду». И он прав. Обилием водопадов, больших и малых, щедро наделены наши западно-кавказские ущелья и каньоны. Взять, например, водопады на западной стенке горы Фишт, самые высокие в России (165 м), в верховьях реки Псоу (водопад Безымянный). На притоке Пшады, в Рогачевой щели насчитывается около 40 водопадов. Долина 33 водопадов есть в окрестностях Сочи. В верховьях Псекупса, Большой Собачки, Грязной, Чепси каждый из водопадов неповторим и оригинален.
Среди водных объектов Кубани привлекательны лиманы – неглубокие водоемы, созданные деятельностью моря или степных рек. Их насчитывается около 250. Наиболее крупные – Ахтанизовский, Восточный, Кирпильский, Ейский.