Когда Геринг вернулся в Берлин с траурной церемонии в Шорфгейде, у его статс-секретаря Пауля Кернера уже лежал в сейфе список лиц (сторонников Рема), подлежавших аресту и ликвидации. 10 июня газета «Фолькишер беобахтер» опубликовала приказ Рема, отданный штурмовым отрядам, в котором говорилось: «Если враги СА питают надежду, что мы, находясь в отпуске, не сможем стать в строй, то они заблуждаются. Ответ будет дан в свое время и в надлежащей форме. СА есть и будут надеждой Германии и средством решить ее судьбу!» Этот приказ показал, что Рем не оставил своих замыслов о захвате власти и после беседы с Гитлером.
Летний отпуск личного состава СА начинался с 1 июля, а 24 июня генерал-полковник фон Фрич отдал войскам приказ «подготовиться, соблюдая осторожность, к отражению атаки штурмовиков, которая обязательно последует». Здесь стоит отметить, что регулярная армия сильно уступала отрядам СА по численности (почти в шесть раз). К тому же Рем и его командиры вовремя узнали о мерах, предпринятых генералами, и собрались на совещание в городе Бад Висзее (где отдыхал Рем), чтобы договориться об ответных шагах. Некоторые штурмовые отряды были подняты по тревоге и переведены на военный режим службы.
В это время Гитлер совершал поездку по Рейнской области, где вел переговоры с представителями местных финансовых и деловых кругов, но Геринг нашел возможность сообщить ему о результатах прослушивания телефонных разговоров. Потом они имели краткую встречу в Берлине, во время которой договорились, что Гитлер возьмет под контроль ситуацию в Баварии, а Геринг — в Берлине и в Пруссии. Рейхсвер же просто стоял в готовности, ожидая приказа своего командующего; поэтому для выполнения активных действий можно было использовать только отряды СС и полицию, все еще находившуюся в подчинении у Геринга.
Рем медлил с выступлением, на 30 июня он не планировал никаких новых шагов. Утром 29 июня газета «Фолькишер беобахтер» напечатала заявление министра вооруженных сил фон Бломберга «О лояльности армии», начинавшееся словами: «Позиция вооруженных сил ясна и недвусмысленна. Мы служим государству, охраняя его от внутренних потрясений, и поддерживаем его руководителей, гарантирующих армии роль единственной вооруженной силы в стране, как и признание и доверие со стороны народа и государства». Это выступление послужило Гитлеру сигналом для начала решительных действий. 30 июня он предпринял активные меры в Баварии, а Геринг — в Берлине. Гиммлер и Гейдрих взяли на себя грязную работу по «ликвидации нежелательных элементов».
Первым делом Геринг отдал приказ отрядам полиции и СС оцепить район правительственных зданий в Берлине и сам, в сопровождении эскорта полицейских, направился в штаб-квартиру СА, находившуюся на Вильгельмштрассе. Штурмовики, застигнутые врасплох, не оказали сопротивления, и полицейские беспрепятственно произвели аресты и изъятие оружия, которого оказалось довольно много. После этого Геринг засел на своей правительственной вилле (на Штреземаннштрассе), откуда стал руководить дальнейшими действиями своих подчиненных.
Прежде всего он созвал «Исполнительный совет по подавлению мятежа», в который кроме него вошли Гиммлер, генерал фон Рейхенау и государственный секретарь Кернер (который вел протокол и все другие записи). На заседании совета присутствовал Мильх, прибывший с докладом о развертывании подразделений люфтваффе. По его словам, Гиммлер, сидя за столом, медленно читал вслух список арестованных, а Геринг и Рейхенау, услышав очередную фамилию, либо кивали в знак согласия, либо отрицательно качали головой; если оба соглашались, то Гиммлер диктовал фамилию Кернеру со словами: «Поступить согласно утвержденной инструкции!» Все это напоминало какую-то зловещую игру, но, судя по количеству важных персон, заполнивших кабинеты виллы, дело приняло самый серьезный оборот. В разгар заседания раздался телефонный звонок из Мюнхена: это был Гитлер, приказавший Герингу и Гиммлеру «закончить дело до утра».
В список приговоренных к смерти было включено 150 высших руководителей СА, обвиненных в измене; их отвезли в полицейские казармы в районе кадетской школы в Лихтерфельде (где когда-то учился Геринг) и посадили в угольный подвал, из которого стали выводить по четыре человека и расстреливать во внутреннем дворе. Многие, не зная, за что их арестовали, пытались протестовать; эсэсовцы срывали с них рубашки и, поставив к стене, стреляли в упор, залпами, потом подходил офицер и добивал раненых выстрелом в голову. Бойня продолжалась несколько часов, к утру все было закончено, все трупы вывезли за город в закрытых грузовиках.
Расправы происходили и в Мюнхене, где арестованных свозили в городскую тюрьму и там расстреливали. Казнью руководил Йозеф Дитрих, командир отряда личной охраны Гитлера. Среди арестованных было много его друзей по прежней службе в Добровольческом корпусе; когда один из них воскликнул: «Зепп, дружище, что происходит? Ведь мы ни в чем не виноваты!» — Дитрих ответил: «Вы приговорены к смерти фюрером! Огонь!»