"Карлсруэ" совершил переход до главной базы ВМФ США на Западном побережье Сан-Диего. Там немецкий корабль был поставлен в док для ремонта тех повреждений, которые оказались не под силу экипажу. Только 17 апреля он вновь вышел в море, но программу похода пришлось сократить. Крейсер взял курс на Панамский канал, и после стоянки в Бальбоа с 27 апреля по 2 мая направился через Атлантический океан домой, без традиционного захода в порты Восточного побережья. 8 июня рейс завершился на стоянке Шиллиг. "Карлсруэ" вновь подвергся нескольким инспекторским проверкам, а 11 июня его посетил Гитлер.
На следующий день корабль прошел Кильским каналом и после высадки кадетов во Фленсбурге прибыл в Киль, на завод "Дойче Верке". С 22 июня по 9 сентября рабочие и инженеры пытались ликвидировать последствия тихоокеанского шторма. Специалисты констатировали, что прочность корпуса "Карлсруэ" значительно ослаблена, и он может не пережить второго такого "приключения". Поэтому в дальнейшем предполагалось использовать его только в качестве учебного корабля в отечественных водах. В течение 1936 г он был вынужден еще раз посетить завод в Киле.
В конце года последовали обычные учения, в ходе которых "Карлсруэ" применялся, в частности, в качестве учебной цели при торпедных стрельбах и сам стрелял торпедами. Однако в декабре гражданская война в Испании потребовала присутствия всех боеспособных германских кораблей в южно-европейских водах.
Приняв топливо в Эль-Ферроле в первый день нового, 1937 г, крейсер проследовал в Гибралтарский пролив, посетив Мелилью и Танжер. Вторая неделя месяца пришлась на крейсерство у берегов Португалии, продолжившееся после кратковременного захода в Танжер с 14 по 19 января. 19 января "Карлсруэ" бросил якорь у мыса Трафальгар, а 21-го перешел на рейд Ла- Коруньи. Теперь в качестве района действий ему назначили северо-западные воды Испании, где он и совершал краткие переходы между Ферролем, Ла- Коруньей и Сан-Себастьяном. 19 февраля крейсер взял курс на Германию, а спустя 3 дня он уже стоял у своего буя А-6 в Кильской бухте.
После короткого "косметического" ремонта и приема снабжения последовали маневры в Балтийском море с участием флотилии подводных лодок "Зальцведель" (различные крейсера типа "К" неоднократно служили учебными целями для этой флотилии). Учения продолжились с апреля по май, после чего 8 мая крейсер перешел на Северное море, в Вильгельмсхафен. После коротких упражнений с флотом он вернулся на Балтику, где в конце мая состоялись боевые стрельбы главным и зенитным калибрами, с 24 мая по 1 июня "Карлсруэ" прошел докование в Киле и продолжил упражнения. Однако состояние корпуса после тихоокеанского шторма продолжало внушать некоторые опасения, и в середине июня крейсер снова побывал в доке фирмы "Дойче Верке". Профилактический осмотр был проведен перед кратким походом в испанские воды. 17 июня крейсер покинул Киль, 21-го принял в Эль-Ферроле топливо и питьевую воду, и встал на якорь в бухте Лагос. 19 июня "Карлсруэ" вновь миновал Ла-Манш и вернулся на родину.
В середине июля состоялись очередные учебные стрельбы на Балтике, после которых крейсер вновь был переброшен на Северное море, где учения продолжились остаток июля и август. В сентябре "Карлсруэ" снова оказался в Балтийском море, где в конце месяца состоялись флотские маневры. Остаток осени также прошел в череде упражнений в обоих морях - Северном и Балтийском. Корабль совершал переходы с театра на театр как по Кильскому каналу, так и проливами Скагеррак и Категат. В конце декабря состоялись учебные торпедные стрельбы, в которых целью для "Карлсруэ" служил "систершип" "Кельн". Учения и маневры продолжились и в начале 1938 г, хотя их интенсивность в зимний период несколько упала.
20 мая крейсер был выведен из состава действующего флота. Он был избран в качестве первого объекта для серьезной модернизации, которую предполагалось осуществить для всех крейсеров типа "К". В ее ходе намечалось устранить недостатки конструкции, связанные с .недостаточной продольной прочностью корпуса. Порядок проведения работ на отдельных кораблях был определен в конце 1937 г. Первоочередность переоборудования "Карлсруэ" была связана в частности с необходимостью окончательно ликвидировать последствия тихоокеанского шторма.