А. М. Василевский, ознакомившись с характером обороны города, уточнил план штурма. Действовать нужно было решительно и быстро. Для этого были приданы сильные огневые средства. С разрешения Ставки фронт получил крупную дальнобойную артиллерию из резерва Верховного Главнокомандования, пять дальнобойных морских железнодорожных батарей дальностью стрельбы до 34 километров. К операции привлекались две воздушные армии, авиация Ленинградского и 2-го Белорусского фронтов, а также 18-я воздушная армия Авиации дальнего действия. В штурме Кенигсберга участвовало 2,5 тысячи самолетов.
Силы большие. Но и задача не из легких. Командованию фронта была известна мощь вражеской обороны. Кенигсберг представлял сильно укрепленную крепость. Основу обороны составляли три рубежа. Первый проходил в 6—8 километрах от города и являлся внешним обводом. Второй опоясывал город по окраинам. Третья линия обороны охватывала центр города и состояла из бастионов в 3—4 этажа. Промежутки между фортами, бастионами прикрывались дотами. Кенигсберг был приспособлен к длительному сопротивлению.
Большое внимание уделялось подготовке артиллерийского наступления. Начальник артиллерии фронта генерал Н. М. Хлебников считал, что она требует четыре дня. Маршал Василевский позвонил в Москву и доложил Ставке:
— Артиллеристы просят четверо суток на артподготовку.
Ставка согласилась с этим сроком. План артиллерийского наступления был утвержден.
Командующий фронтом постоянно в войсках. Ни один из вопросов, касающихся подготовки к штурму Кенигсберга, не остался без его внимания. 3 апреля он приехал на командный пункт 11-й гвардейской армии, войскам которой надлежало овладеть южной частью города. Ознакомился с обстановкой, оперативным построением войск, их взаимодействием при штурме, подготовительными мероприятиями по форсированию реки Прегель.
Выслушав доклад и уточнив задачу армии на местности, А. М. Василевский утвердил решение командарма и в целом план операции, внеся в него некоторые изменения и уточнения. В сопровождении командарма Александр Михайлович отправился по ходам сообщения на передний край, в траншеи 1-й Московско-Минской дивизии. Проверил подготовку к штурму частей, беседовал с солдатами о предстоящих боях.
На следующий день А. М. Василевский прибыл на командный пункт 50-й армии. Командарм доложил о боевой готовности войск. Ночью они намеревались захватить внезапным ударом малый форт и тем самым пробить брешь в сплошной обороне противника. Это облегчило бы штурм города. Командующий фронтом утвердил представленный план.
Затем А. М. Василевский прилетел в район к северо-востоку от Кенигсберга и расположился на командном пункте Земландской группы советских войск. Внимательно ознакомился с деталями предстоящего штурма. Выразил удовлетворение проделанной работой и объявил решение Ставки о выводе Земландской группы в резерв.
Накануне штурма А. М. Василевский обратился к немецким войскам с призывом сложить оружие. Разъяснял, что сопротивление бесполезно. Ответа не поступило. Советские войска с сознанием справедливости своей миссии были готовы начать боевые действия... Утро 6 апреля выдалось туманное, и авиация не могла сразу поддерживать наземные войска. Командующий фронтом звонит командарму-50 генерал-лейтенанту Ф. П. Озерову:
— Федор Петрович, будем начинать атаку без авиации или отложим?
Командарм за то, чтобы операцию не откладывать, а начать немного позже. Такого же мнения придерживались другие командармы.
Ровно в 10 часов тысячи орудий и минометов трех наступавших с севера армий открыли мощнейший огонь — били по укреплениям и пехоте противника. В полдень вслед за огневым валом артиллерии в сопровождении танков ринулась в атаку пехота.
А. М. Василевский сначала наблюдал за ходом боя с командного пункта 43-й армии, а затем выехал на передний край. Ни днем ни ночью не затихал штурм. Враг предпринимал яростные контратаки, бросал в бой наскоро сколоченные отряды фольксштурма. Гитлеровцы перегруппировали войска, ввели в бой все свои резервы. Но остановить лавину наступления советских войск им не удалось.
9 апреля враг сдался.
При допросе комендант крепости генерал Лаш признался, что массированное применение артиллерии и самолетов разрушило укрепления, деморализовало солдат и офицеров. Было полностью потеряно управление. «Выходя из укреплений на улицу, чтобы связаться со штабами частей, мы не знали, куда идти, — говорил он, — совершенно теряли ориентировку — настолько разрушенный и пылающий город изменил свой вид. Никак нельзя было предполагать, что такая крепость, как Кенигсберг, столь быстро падет. Русское командование хорошо разработало и прекрасно осуществило эту операцию».