В XIX–XX веках правители Афганистана, такие как Дост Мухаммад, эмир Шер Али-хан и Абдуррахман-хан, а также Шах Махмуд-хан, министр обороны короля Надир-хана, периодически приходили со своими войсками в эту долину и заставляли его жителей платить налоги центральным властям. Как уже отмечалось, через Панджшер проходила главная дорога, связывавшая районы северного и южного Гиндукуша, что давало его жителям определенные экономические выгоды, так как они собирали налоги за проход караванов через их территорию. Открытие тоннеля Саланг (в 1964 году) нанесло серьезный удар по экономике долины, все грузопотоки пошли в обход Панджшера.
Большинство жителей Панджшера являются таджиками, небольшая их часть — хазарейцы, проживающие в деревнях Джир Али, Санг-хан, Баба Али, Гулаб-хел и Астана, волости Дара. По версии некоторых этнологов, таджики — арийцы, прибывшие сюда за тысячелетия до н. э. из районов к северу от Гиндукуша, и их происхождение определяется обычаями, традициями, языком дари и культурой. Некоторые таджики считают, что их предки около 700 лет назад переселились в эти места из района Дахбек, находящегося под Самаркандом. Хазарейцы были переселены в Панджшер при правлении династии Абдали из провинции Кандагар.