Афины решили всеми силами отстоять целость морского союза, на котором покоилось их значение как великой державы. Харес получил приказание вести свой флот к Хиосу, и туда же была отправлена из Афин другая эскадра под начальством Хабрия. Город Хиос был заперт с суши и с моря; но нападение на гавань, произведенное Хабрием, было отражено осажденными, причем знаменитый полководец и сам пал, храбро сражаясь.
После этого пришлось снять осаду Хиоса, и союзники в свою очередь перешли в наступление. Они собрали флот в 100 триер, опустошили острова Лемнос и Имброс и приступили к осаде Самоса, важнейшего внешнего владения Афин. Харес, располагая всего шестьюдесятью кораблями, принужден был оставаться безучастным зрителем; ввиду этого афиняне снарядили новый флот в 60 триер и во главе его поставили обоих лучших полководцев этого времени, Ификрата и Тимофея (середина лета 356 г.). Афины имели теперь на море 120 триер — сила, какою они не располагали со времени битвы при Эгоспотамах. Ближайшая цель — освобождение Самоса от осады — действительно была достигнута, но тем и ограничились успехи похода. Попытка овладеть Византией ни к чему не привела; затем афинские полководцы снова обратились против Хиоса, и здесь, в проливе, отделяющем остров от близкого материка, у Эмбаты в эретрийской области, встретили весь неприятельский флот. Море было бурно в этот день, и Ификрат с Тимофеем при таких условиях не хотели рисковать битвой; Харес требовал нападения, но, покинутый своими товарищами, принужден был с уроном прекратить уже начатую битву.
Известие об этих происшествиях вызвало в Афинах сильное возбуждение. Чем смелее были надежды, которые афиняне возлагали на действия громадного флота под командою таких полководцев, как Ификрат и Тимофей, тем сильнее должно было быть теперь разочарование, когда оказалось, что действительность не оправдала этих надежд. Чем можно было объяснить эту неудачу, как не тем, что полководцы были подкуплены врагом? Ификрат, Тимофей и сын Ификрата Менесфей, командовавший рядом с отцом, были отставлены от должности и вызваны в Афины для представления отчета.
Смещенных военачальников привлек к суду Аристофон из Азении. Он некогда был товарищем „освободителя" Фрасибула и являлся, может быть, единственным участником тогдашней борьбы, принимавшим теперь участие в политической жизни; позднее он примкнул к Каллистрату, затем был вовлечен в ту серию процессов, которая привела к низвержению этого деятеля, и лишь с большим трудом избег смертного приговора. Харес также употребил все свое влияние, чтобы погубить своих товарищей по командованию флотом, потому что он сам мог избегнуть ответственности только в том случае, если бы ему удалось всю вину свалить на них. Обвинение, по крайней мере в главном, достигло своей цели. Правда, Ификрат и Менесфей были оправданы, но Тимофей, политически самый видный из обвиняемых, был признан виновным в принятии подкупа от хиосцев и приговорен к штрафу в 100 талантов. Он был одним из богатейших людей в Афинах, но его состояния далеко не хватало на покрытие такой суммы, и старый полководец должен был удалиться изгнанником в Халкиду, где вскоре и умер. Так кончил жизнь сын Конона, человек, которому, наряду с Каллистратом и Хабрием, Афины более всего были обязаны восстановлением своего владычества на море. Как ни были велики его военные дарования, но своими успехами он был обязан более своей дипломатической ловкости, чем оружию; возможно, что и в войне с Хиосом он доверился этому своему искусству и потому вел войну с меньшей настойчивостью, чем следовало с чисто военной точки зрения. Но невозможно сомневаться в том, что его осуждение было незаслуженно; афиняне сами вскоре сознали это и после смерти Тимофея сбавили его сыну Конону цифру штрафа до десяти талантов.
Харес был назначен теперь единоличным начальником флота; но это не улучшило положения. Дело в том, что финансовые силы Афин были вконец истощены большими снаряжениями последних лет; чтобы флот не распался, Харес должен был сам добыть необходимые средства. И как раз теперь удобный случай к этому представляли вновь вспыхнувшие в прибрежных провинциях Персидского царства внутренние смуты.