Для предотвращения заражения необходимо соблюдать санитарные требования как в самой шампиньоннице, так и на прилегающей к ней территории. Компостирование нельзя проводить на земляном полу. Субстрат надо правильно пастеризовать в течение 12 ч при температуре 60 °C. Предпочтительнее использовать мешки из полимерной пленки, что снизит опасность распространения инфекции при выкладке шампиньонниц. Кроме того, следует неукоснительно выполнить все мероприятия (подготовка селекционного субстрата, быстрое проращивание мицелия, перемешивание его с пастеризованным субстратом и другое), ускоряющие рост мицелия и плодообразования. Это поможет снизить риск потери урожая.
Если же плесень уже занесена в шампиньонницу, то обрезки ножек и прилипший к ним покровный материал нельзя разбрасывать. Их надо собрать в мешки из полимерной пленки и сложить в специально приготовленную для этого яму. Эти отходы каждый день необходимо поливать раствором медного купороса. Яму же требуется засыпать землей. Все помещение, в котором упаковывается шампиньонница, нужно каждый день мыть и дезинфицировать раствором медного купороса. Все вентиляционные отверстия должны быть забраны сетками. До и после работы в шампиньоннице следует мыть все рабочие инструменты, стирать рабочую одежду, мыть и дезинфицировать обувь раствором медного купороса, мыть руки с мылом.
Всю территорию в шампиньоннице требуется раз в неделю опрыскивать 1 %-ным раствором медного купороса. Использованный субстрат перед удалением его из шампиньонницы надо обработать раствором медного купороса. Его можно использовать в качестве органического удобрения только там, где нет шампиньонниц. Производственные помещения также следует пропаривать вместе с субстратом.
Желто-зеленой плесенью субстрат в шампиньонницах поражается довольно часто. Грибы становятся слабыми, серого цвета; мицелий же постепенно отмирает. На его месте образуются плесневелые грибы с желто-зелеными спорами и белесым мицелием. Он имеет характерный запах плесени и кажется вязким. Эта болезнь вызывается несколькими разными плесневыми грибами. Они способны развиваться одновременно, и изолировать их довольно трудно. Этот вид плесени распространен в природе. В субстрат попадает вместе с исходными материалами и наравне с другими микроорганизмами участвует в компостировании. Желто-зеленая плесень начинает развиваться при температуре 45 °C. Она полностью погибает при хорошей пастеризации. Если же пастеризация выполнена недобросовестно, а сам субстрат низкого качества, то плесень довольно быстро поражает мицелий шампиньона на ранних стадиях развития. Инфекция способна проникнуть и в качественный субстрат. Источниками заражения могут служить зараженный отработанный субстрат, который разбросали возле шампиньонницы и участка для компостирования, ветер и пыль, обувь, инструменты. Если инфекция занесена в сравнительно позднее время, когда мицелий полностью сформировался и началось плодообразование, то риск потери урожая немного снижается.
Для предотвращения данного заболевания надо всегда соблюдать все правила гигиены на компостной площадке. Не стоит использовать долго хранившийся птичий помет. Компостирование следует проводить, придерживаясь всех требований и размещая его в зоне буртов. Субстрат всегда нужно подвергать термической обработке. Кроме того, его требуется увлажнять сразу же после извлечения из него шампиньонницы. В ветреные дни нежелательно проводить ее очистку. Отработанный субстрат необходимо вывозить в мешках из полиэтиленовой пленки. Шампиньонницу регулярно мыть и дезинфицировать фунгицидами.
Карминная плесень вызывается плесневелым грибом Sporendomena purpurescens Bon. Она появляется во время плодоношения в виде белых пуховичков или покрова мицелия между комками покровного материала. Мицелий этой плесени развивается очень быстро и накрывает весь слой покровного материала. Воду при поливах не впитывает. У шампиньона плодоношение сперва снижается, затем прекращается вовсе. Мицелий плесени желтеет, позже становится вишнево-красным и начинается спорообразование. Этот гриб очень любит азот и развивается в субстрате, богатом им. Если температура субстрата становится 10–18 °C, то рост гриба плесени усиливается, а развитие культивируемого гриба, напротив, замедляется.
Для предотвращения данного заболевания следует избегать субстрата, перенасыщенного азотом и переувлажненного. Очень осторожно надо вносить азотные удобрения. При термической обработке субстрата непременно должен быть приток свежего воздуха. Аммиак обязан при этом полностью освободиться. Температура субстрата также всегда должна быть оптимальной для культивируемого гриба.