И на войне, и в мирное время в ордене поддерживалась жесткая дисциплина. В мирное время рыцарей карали ударами плети, снятием плаща (на срок до одного года), физическими работами вместе с невольниками. Наказывать плетью мог только магистр и только в своей палатке, без присутствия посторонних лиц. Тяжким наказанием являлось временное лишение коня и оружия. Но самой суровой карой являлось изгнание из ордена без освобождения от обетов, что фактически ставило виновного вне общества. Такое наказание предусматривалось за бегство с поля битвы, впадение в ересь, скотоложство, продажу должностей.
В мирное время, чтобы не терять воинских навыков, крестоносцы должны были заниматься фехтованием и упражняться с копьем, стрелять из луков и арбалетов по птицам, охотиться на львов (в Палестине) и других крупных зверей.
Войско Тевтонского ордена отличалось от других войск феодальной эпохи образцовой дисциплиной, а также высоким уровнем военной подготовки рыцарей. Крестоносцы умели строить и штурмовать замки, имели хорошо налаженную систему разведки.
С самого начала своего существования Тевтонский орден нес тяжелые потери в людях. Во время одной из битв с турками-сельджуками в марте 1210 года погибло большинство рыцарей, а верховный магистр вскоре умер от ран.
Избранный на его место Герман фон Зальца (четвертый по счету хохмайстер) сказал, что был бы рад потерять один глаз, если бы за это получил хоть десяток боеспособных рыцарей. Случилось так, что именно при нем дела ордена пошли лучше.
Герман фон Зальца (
Император присвоил Герману фон Зальца и всем его преемникам титул князя Священной Римской империи, разрешил помещать изображение имперского орла на личных гербах и хоругвях. В 1221 году специальным привилеем император взял орден под свою опеку вместе со всем движимым и недвижимым имуществом, освободил от имперских налогов и повинностей.
Папа римский Гонорий III (занимал престол в 1216–27 гг.) в том же году подарил верховному магистру драгоценный перстень. Отсюда пошел обычай передавать каждому новому магистру вместе с крестом и этот перстень. Заодно папа вывел орден из-под юрисдикции светских властей.
Иерусалимский король в качестве награды за отвагу позволил магистру фон Зальца и тем, кто придет на его место, носить иерусалимский крест над черным орденским крестом.
Тевтоны были участниками всех предприятий крестоносцев и показали себя с наилучшей стороны. Однако уже стало ясно, что победа в конечном итоге останется за мусульманами. Герман фон Зальца начал предпринимать меры для обеспечения своему ордену другого поля деятельности.
Еще в 1211 году венгерский король Андрей II пригласил тевтонцев в Семиградье, чтобы они организовали отпор нападениям кочевников-половцев. Крестоносцы прибыли туда в значительном числе и успешно справились с задачей. Однако в скором времени король Андрей расторг приглашение и изгнал рыцарей. Затем в 1222 году вернул их назад, потом в 1225 снова отобрал подаренные земли. Причина была в том, что тевтонцы стремились к максимальной автономии полученного ими владения, в чем король справедливо видел угрозу целостности своего государства. Закрепиться в Семиградье ордену не удалось.