В сентябре 1943 года В. Мюллер был назначен начальником штаба 4-й армии, входившей в группу «Центр». К тому времени фашистский вермахт уже потерпел новое поражение под Курском. Мюллер сделал в связи с этим следующую запись, сохранившуюся в его архиве:
«После Сталинграда германское Верховное командование потеряло инициативу, она прочно перешла к Красной Армии, которая начала осуществлять решающий перелом не только на Восточном фронте, но и во всей мировой войне. Еще одна попытка командования и Генерального штаба завладеть инициативой под Курском в июле 1943 года, разгромить сосредоточенные там советские соединения, уничтожить наличные советские резервы и выиграть таким образом войну потерпела полное крушение. Это стало ясно уже после нескольких дней советского контрнаступления, в ходе которого вермахт понес огромные потери. В итоге битва под Курском привела к обратным результатам: Красная Армия окончательно захватила инициативу и добилась перелома как на Восточном фронте, так и в ходе всей войны за год до создания второго фронта американцами и англичанами. После Курска вермахт стал терпеть одно поражение за другим. Немецкий восточный фронт постепенно разваливался на куски».
Во время отпуска, после совещания генералов в Зонтхофене, Мюллер встретился в Берлине в экипировочном фонде со своим бывшим сослуживцем по Первой мировой войне, сотрудником ведомства Канариса Вальтером Боймельбургом, братом известного в свое время националистического историка Вернера Боймельбурга. В архиве Мюллера мы находим следующую запись о состоявшейся между ними беседе:
«На вопрос Боймельбурга, ожидается ли в ближайшее время на участке группы армий "Центр" наступление русских, я ответил утвердительно. "Хотя с начала марта, — сказал я, — у нас спокойно, но на некоторых участках, и, кстати, на очень важных, ясно видно, что русские готовятся к наступлению. При взгляде на карту становится очевидным, что русские будут наступать прежде всего на участке группы армий "Центр", где наша линия фронта образует глубокий выступ". Боймельбург возразил, что, по сведениям, полученным из Швейцарии, русские продолжат сначала наступление на Украине и против Румынии. Когда я высказал сомнение по этому поводу, Боймельбург заявил: "Главный штаб вермахта все же склоняется к мнению, что в этом году русские начнут наступление именно на южном участке фронта"».
После начала Нюрнбергского процесса В. Мюллер сообщил в письме советскому правительству некоторые известные ему подробности о нападении на Советский Союз. Этот документ, из которого видно также отношение самого Мюллера к этому преступлению фашистов, впервые полностью публикуется:
«Правительству СССР
На Нюрнбергском процессе впервые были приведены исчерпывающие доказательства, подтверждающие чудовищные преступления нацистов против мира и их варварские методы ведения войны. Эти злодеяния завершились вероломным нападением на Советский Союз, предпринятым в нарушение существовавших соглашений.
Как бывший генерал германской армии, принимавший участие в этой войне, я несу свою долю ответственности и поэтому считаю своим долгом сообщить все известные мне подробности о подготовке и осуществлении нападения на Советскую Россию.
Я прошу поэтому правительство СССР принять изложенные мною данные и предоставить мне возможность сделать публичное заявление по вопросу о нападении Германии на Советский Союз.