Анализируя складывающуюся военно-стратегическую обстановку и темпы развертывания стратегических ракет, Министерство обороны директивой от 4 апреля 1959 г. принимает решение увеличить количество полков к 1.07.1959 г. до 22. Для развертывания ракетных частей приспосабливаются обособленные военные городки различных родов войск, как с хорошо развитой структурой, так и находящиеся в полузапущенном или заброшенном состоянии. При личном участии заместителя министра обороны СССР главного маршала артиллерии М.И. Неделина развертыванием ракетных соединений и частей в этот период непосредственно руководят параллельно Главный штаб ВВС – по формированиям, создаваемым в ДА ВВС, и Штаб реактивных частей – по формированиям, создаваемым в частях РВГК.
Подготовка полков шла в 4 этапа. На первом этапе, с момента формирования по январь 1959 г. проводилась теоретическая подготовка офицеров, рядового и сержантского состава и слаживание личного состава эскадрилий для работы на технической и стартовой позициях. На втором этапе, в течение февраля – апреля 1959 г. эскадрильи после получения комплекта техники и учебной ракеты Р-2 (8Ж38) отрабатывали на учебных позициях подготовку ракеты к пуску. Третий этап для сформированных полков начался в мае – июне 1959 г. на полигоне Капустин Яр. После доподготовки под руководством полигонных специалистов все эскадрильи проводили учебно-боевые пуски ракет 8Ж38, после чего одна эскадрилья полка изучала ракету Р-5М, проводила ее предстартовую подготовку. На четвертом этапе по декабрь 1959 г. авиационные полки переходили на ракеты Р-5М или Р-12.
Первыми на полигон со своей техникой несколькими эшелонами в марте – апреле 1959 г. прибыли 214 и 122-й ап, сформированные в г. Умань. В июне и июле 1959 г. боевые расчеты полков проводят первые пуски ракет, переходят на штаты дивизионов и стартовых батарей, предназначенных для вооружения ракетами Р-12 (8К63), и начинают переучивание на новую технику. По окончании обучения полки непосредственно с полигона направлялись к новым местам дислокации.
При выборе пунктов дислокации ракетных полков необходимо было учитывать возможность выбора в последующем стартовых позиций, наличие железнодорожной станции (платформы), обеспечивающей выгрузку крупногабаритной техники, подъездных путей, возможности выхода на линии связи, а также емкость фондов. На новом месте необходимо было выбрать позиционные районы, построить стартовые позиции и обеспечить готовность к их занятию для несения боевого дежурства ракетными полками.
К размещению стартовых позиций, КП и других элементов боевого порядка предъявлялись жесткие требования: они должны были размещаться в лесистой местности, на удалении 20—30 км от пункта дислокации, международной авиалинии и железнодорожной станции выгрузки. Удаление от государственной границы определялось расстоянием, исключающим поражение стартовых площадок наземными средствами. Позиция станции боковой радиокоррекции выбиралась на удалении 20—40 км от стартовой позиции строго в створе: объект поражения – стартовая позиция.
В августе 1959 г. четыре полка в ускоренном порядке заступили на боевое дежурство в позиционных районах. Личный состав и ракеты размещались в специальных палатках, наземное оборудование – на открытых площадках. С наступлением осени пошли дожди, в лесу стало сыро и холодно, начались болезни, настроение личного состава стало падать. В конце октября того же года полки были отозваны с боевого дежурства и возвращены в пункты постоянной дислокации.
Небольшой, практически трехмесячный опыт несения боевого дежурства по этому варианту показал все его недостатки. Руководство пришло к твердому убеждению, что ракетные части – это части постоянной боевой готовности, а все элементы боевых порядков должны быть заблаговременно построены и заняты. Для личного состава должны быть оборудованы казармы, а для ракет и головных частей в технической зоне построены специальные хранилища. В позиционном районе полка постоянно должны находиться расчеты, способные подготовить и провести пуск ракет. Таким образом, формировались принципы боевого применения ракетных частей, методов работы по выбору и оборудованию позиций, организации подготовки личного состава. Все это в последующем было использовано в работе оперативного управления Главного штаба Ракетных войск.
Командованию формируемых полков предстояло в короткие сроки принять и разместить сотни прибывающих офицеров и членов их семей, военнослужащих срочной службы из различных родов войск. Необходимо было организовать их питание, обеспечить хотя бы элементарные бытовые условия, обеспечить их обмундированием и военным имуществом, сформировать боевые подразделения и подразделения обслуживания и обеспечения, штабы и службы частей.