За два дня до начала операции противника против Марианских о-вов, а именно 9 июня, наши самолеты-разведчики совершили разведывательный полет над атоллом Маджуро, который служил базой американского военно-морского флота. Разведка не обнаружила находившихся там до последнего времени американских кораблей. Эти данные наряду с агентурными донесениями свидетельствовали о том, что намечается крупная операция американского военно-морского флота. Исходя из этого, главнокомандующий Объединенным флотом 10 июня отдал приказ о подготовке к решающему сражению в соответствии с оперативным планом «А». Однако приказа о начале сражения, который ожидался в связи с нападением оперативного объединения противника на Марианские о-ва, пока не последовало. Видимо, произведенная атака расценивалась всего лишь как воздушный налет, какие неоднократно совершались и прежде. Поскольку существовало опасение, что высадка десанта может произойти на другом направлении, 1-й воздушный флот воздерживался от активных наступательных действий.
Однако, когда 13 июня начался обстрел из корабельных орудий, обстановка в основном прояснилась. Главнокомандующий Объединенным флотом Тоёда, находившийся на якорной стоянке у о. Хасира в западной части Внутреннего моря, вечером 13 июня отдал приказ о готовности к решительному сражению по оперативному плану «А». Этим же приказом временно приостанавливались действия по плану «операции единения» и занятые в ней части возвращались к месту постоянного базирования. Затем рано утром 15 июня был отдан приказ о начале решительного сражения согласно оперативному плану «А», 1-му воздушному флоту было приказано начать наступление. В тот же день приказом ставки Объединенному флоту были переданы главные силы военно-морской авиации из Йокосука (около 120 самолетов). Тоёда сформировал из них авиационное соединение Явата, направил его на о. Иводзима с подчинением командующему 1-м воздушным флотом. В результате этих мер почти все силы базовой авиации японского военно-морского флота (всего 360 самолетов) были развернуты для участия в операции «А».
1-й маневренный флот — одно из основных среди соединений, выделенных для участия в решительном сражении, — 16 мая сосредоточился в гавани Тавитави, в юго-западной части Филиппин, откуда 13 июня вышел на север к проливу Гимарас. В пути командующий Одзава получил приказ о готовности к решительному сражению в операции «А» и приказал присоединиться к нему 1-й дивизии линейных кораблей, 5-й дивизии крейсеров и 2-й эскадре эскадренных миноносцев, которые находились в районе к северу от Австралии. Следуя прежним курсом, главные силы флота прибыли в пролив Гимарас, а в 8 час. утра 15 июня двинулись к Марианским о-вам.
Вечером 15 июня маневренный флот проходил через пролив Сан-Бернардино в центральной части Филиппинских о-вов. На основании сообщений, перехваченных с подводных лодок противника, было установлено, что он следит за действиями наших сил.
После потери базовой авиации на Марианских о-вах приходилось возлагать надежды на 480 самолетов, которые должны были вернуться из района к северу от Австралии. Однако командование обманулось в своих ожиданиях. Поэтому в решительном сражении операции «А» могли принять участие только соединение Явата из собственно Японии и оставшиеся самолеты с о-вов Трук. Дело в том, что генерал-лейтенант Сумида намеревался с началом решительного сражения перебросить на о. Гуам части, расположенные на о-вах Трук, но они вступили в воздушный бой с группой истребителей противника над о. Гуам, понесли потери и в дальнейшем смогли лишь незначительными силами атаковать корабли противника на подступах к Сайпану. Соединение Явата тоже вступило в бой с самолетами неприятельского маневренного соединения и, не нанеся противнику ощутимого урона, утратило свою боеспособность.
Таким образом, дело кончилось тем, что 1-й воздушный флот, в состав которого входили почти все части базовой авиации нашего военно-морского флота, был уничтожен, так и не сумев нанести эффективного удара по врагу. Очевидно, главной причиной, имевшей губительные последствия, явилось то, что инициатива была отдана противнику. Вместе с тем сыграли свою роль и такие факторы, как слабое руководство боевыми действиями, недостаточная степень подготовки экипажей и неудовлетворительная готовность баз. Число самолетов, которые фактически приняли участие в операции «А» и вели бои, не превышало и 20 % их общей численности.[97]
16 июня 1-й маневренный флот, следуя на восток, в открытом море к северу от о-вов Палау объединился с отрядами, участвовавшими в «операции единения», и на рассвете 19 июня появился западнее\ о. Сайпан. Здесь было принято решение разгромить группу ударных авианосцев и другие группы маневренного соединения противника.