Первой целью восставших стал замок Кумамото. Его гарнизон состоял из солдат, набранных на основании закона о всеобщей воинской повинности, то есть из простонародья. Против ожиданий благородных бунтовщиков одолеть неприятеля с налёту не получилось. Представители обновлённой армии оборонялись отчаянно, и штурм Кумамото провалился. Потери с обеих сторон были невелики, что можно объяснить тем, что и самураи, и вчерашние крестьяне не вполне освоили обращение с новыми огнестрелами. Замок осадили, но время работало против мятежников. На севере Кюсю оперативно сосредоточились правительственные войска под командованием Ямагата Аритомо (формально командующим числился принц Тарухито Арисагава). К началу марта Аритомо собрал достаточно сил и счёл, что пришло время действовать. Для начала нужно было деблокировать замок Кумамото и соединиться с его героическим гарнизоном. 4 марта на склонах Табарудзаки наступающие войска столкнулись с мятежниками. Последние обладали численным превосходством, которое, впрочем, не сильно помогло, так как армия Сайго страдала от недостатка боеприпасов. Солдаты Аритомо не имели подобных проблем, и свинцовый дождь, обрушившийся на бунтовщиков, не ослабевал. Почти одновременно с началом боёв за Табарудзаку Аритомо высадил десант в Кагосиме, что имело катастрофические последствия для тылов мятежной армии. Склады с амуницией и боеприпасами стали так же недостижимы, как цитадель Кумамото. Однако упорства самураям было не занимать, и по склонам Табарудзаки продолжали стекать кровавые ручьи. Расстреляв все боеприпасы, мятежники бесстрашно переходили в рукопашную, как бы возвращая те славные времена, когда о варварских мушкетах и слыхом не слыхивали. Счёт убитых шёл на тысячи. Словно желая охладить разбушевавшихся людей, небеса разверзлись, и на землю обрушились потоки ледяного дождя. Накал сражения не уменьшился, самураи Сайго стояли насмерть. Проблема была в том, что с другой стороны им противостояли такие же бесстрашные японцы, не щадящие своих жизней в борьбе за правое дело. Ямагата Аритомо проявил себя отличным стратегом и не стал упорствовать в лобовых ударах. Две пехотные бригады под его руководством высадились у города Яцусиро, соединились с местным полицейским корпусом и ударили в тыл бойцам Сайго. В сражении наступил перелом, и 20 марта господствующая высота перешла в руки правительственных войск. Мятежники отступили на восток, что стало началом конца.
Ход дальнейших событий отлично известен всякому, кто знаком с историей восстаний, мятежей, крестьянских войн и тому подобных мероприятий. Героическая борьба, поражение, отступление, потеря городов и снова отступление. Героические соратники пытаются развалить тыл правительственных войск, но вскоре головы героических соратников украшают стены местного райцентра, а карательные батальоны множатся, как грибы после дождя. Сацумский мятеж завершился у горы Сирояма. Под началом Такамори осталось меньше тысячи бойцов, в то время как Ямагата Аритомо выставил тридцатитысячную армию. Интересно, что незадолго до этого наш герой попытался мобилизовать всё тех же крестьян, впрочем, вполне безуспешно. От Сайго потребовали безоговорочной капитуляции, что для благородного воина было немыслимо. 24 сентября солдаты устремились на последний оплот мятежников. Интересно, что на гравюре, иллюстрирующей этот эпизод, бойцы правительственных войск бегут на врага, вооружённые исключительно холодным оружием, а почти все самураи-мятежники направили на них стволы ружей. Сайго Такамори не пережил последнего боя. Получив тяжёлую рану в живот, он совершил сэппуку. Его верный помощник Бэппу Синсуке отрубил голову своему командиру и передал его слуге. Останки Сайго Такамори так и не нашли, а сам Бэппу Синсуке не встретил восхода луны.
Мятеж был подавлен, несколько позже состоялось вторжение в Корею, за которое так ратовал покойный Сайго, а он сам постепенно превратился в народного героя. О нём слагали песни, ставили спектакли, а сторонники теории заговора уверяли, что Сайго не умер, а скрывается в холодной России и недалёк час его возвращения. Песню о Сайго распевали марширующие солдаты, пьесу о героическом Такамори исполняли столичные актёры. Власть предержащим оставалось либо вступить в новую войну уже с призраком, занявшим прочные позиции в умах народа, либо смириться и сделать вид, что Сайго на самом деле был не так уж и плох. В 1889 году государь простил покойного бунтовщика посмертно, а в 1902-м сын Такамори получил титул маркиза.