Патриарх Тихон резко осудил изъятие церковных ценностей, а верующие активно сопротивлялись этому процессу. К концу 1922 г. по делу об изъятии церковных ценностей были расстреляны и погибли более восьми тысяч человек. В марте 1922 г. в газете «Известия» был опубликован «Список врагов народа», и первым в нем был указан патриарх Тихон с церковным Собором. С лета 1922 г. по июнь 1923 г. патриарх был под арестом в московской тюрьме на Лубянке. А до этого он пребывал под домашним арестом в своем Троицком митрополичьем подворье на ул. Самотека.
Наряду с конфликтами с властями были у патриарха Тихона и другие серьезные тревоги. В новых исторических условиях в ущерб авторитету, силе и мощи Русской православной церкви в ней усиливалось движение «обновленцев». Они шли на компромиссные союзы с властями и стремились захватить Церковь в свои руки. В период обновленческого раскола патриарху и его сторонникам удалось сохранить истинную Христианскую церковь.
Патриарха Тихона все-таки освободили из тюрьмы, ему пришлось поселиться в московском Донском монастыре. На патриарха Тихона было совершено два покушения. Первое произошло в 1919 г. при выходе из храма Христа Спасителя, когда женщина ударила его ножом в бок, тогда патриарха спас кожаный пояс на подряснике под рясой, смягчивший удар ножа. Второе покушение на патриарха произошло в Донском монастыре в 1924 г. Неизвестные ворвались в его келью, раздалось пять выстрелов, но келейник патриарха – Я.А. Полозов – успел заслонить его, но сам был убит. Неизвестным удалось скрыться.
Вынос тела Патрирха Тихона после отпевания. Донской монастырь. 1925 г.
У патриарха время от времени случались обмороки, врачи обнаружили у него заболевание почек, болезни обострялись. В 1925 г. его положили на лечение в частную московскую лечебницу. В один из дней он почувствовал себя хуже и согласился для улучшения самочувствия сделать ему укол морфия. После этого через несколько часов он умер. Мало кто верил в его естественную смерть, ибо за годы советской власти неоднократно пытались совершить насилие над его телом и духом. Патриарх Тихон был канонизирован в 1989 г. (а Русская православная зарубежная церковь осуществила канонизацию в 1981 г.). Его мощи покоятся в Донском монастыре в Москве.