Основным назначением всех аналитических методов является обработка полученных сведений, установление взаимосвязи между фактами, выявление значения этих связей и выработка конкретных предложений на основе достоверной и полной, аналитически обработанной информации. Существует широкий спектр специальных методов анализа: графические, табличные, матричные и т. п., например, диаграммы связи и матрицы участников, схемы потоков данных, временные графики, графики анализа визуальных наблюдений VIA (visual investigative analysis) и графики оценки результатов PERT (program evaluation review technique). Тем не менее следует отметить, что у каждого аналитика есть свой собственный метод анализа, который может быть как комбинацией вышеперечисленных методов, так и сугубо индивидуальным, уникальным методом аналитической работы.
С помощью диаграмм связей выявляется наличие связи между субъектами, вовлеченными в конкретную ситуацию, подвергающуюся анализу, а также области общения, соприкосновения этих субъектов. На диаграмме связей отмечают как наиболее прочные, так и вспомогательные связи между субъектами. Анализируются все связи без исключения, так как в ходе развития событий и получения дополнительной информации вспомогательные связи могут выступить на первый план. Для большей наглядности следует также указывать на диаграмме связи должностей (для физических лиц) или род деятельности (для юридических лиц).
Матрицы связей отражают частоту взаимодействия субъектов за определенный период времени. Такой метод анализа дополняет диаграммы связей, позволяет оценить характер взаимодействий между субъектами через частоту таких взаимодействий. При использовании этого метода анализа до его начала необходимо отделить маловажные и не имеющие отношения к делу, пусть даже частые, взаимодействия субъектов.
Схемы потоков информации позволяют оценить то, каким образом происходят события. С их помощью можно анализировать пути движения информации среди субъектов анализа, т. е. оценивать положение каждого субъекта в общей группе и выявлять неустановленные связи между субъектами, используя определенную, специально подготовленную информацию как индикатор. Метод применим для отображения, например, физических процессов, взаимодействия юридических и физических лиц.
Временные графики используются для регистрации событий. Такая форма представления данных помогает не только эффективнее анализировать события, но и более рационально планировать меры противодействия.
Графики анализа визуальных наблюдений VIA являются составной частью графиков оценки результатов PERT. Оба графика составляются по принципу разбивки сложной операции на составные элементы. Такой принцип позволяет наглядно отражать ход событий. В зарубежных странах графики VIA и PERT применяются для анализа тяжких преступлений и террористической деятельности, для повышения эффективности работы предприятий, а также аналитиками служб безопасности для нужд ИАС фирм. В обоих графиках принята одна и та же система символов: события представлены треугольниками и кругами, причем треугольники отмечают начало и конец события, а также наиболее важные моменты операции. Отличием этих типов графиков является то, что график VIA представляет собой схему визуальных наблюдений в процессе одиночного события, а график PERT отражает общий ход событий, является более общим методом анализа. Графики VIA и PERT могут иметь различную степень детализации событий. С их помощью легко вычленить определенную схему в действиях субъектов, что значительно облегчит процесс построения версий. Графики PERT широко применяются при таком широко распространенном методе анализа, как изучение реальных дел с целью поиска аналогий. Такой метод позволяет определить возможные сценарии, по которым события реально развивались в предшествующий период. Основная идея этого метода состоит в том, что все события рано или поздно повторяются в силу схожести целей, средств и обстоятельств. Разбор и анализ ситуаций, имевших место в прошлом, позволяет на раннем этапе выявить подлинный характер происходящего за счет совпадения с типичными схемами.
В настоящее время в работе ИАС широко используются возможности современной вычислительной техники. Это относится не только к созданию баз данных по тематике аналитической работы, но и непосредственно к процессу анализа. Статистический анализ в подавляющем большинстве случаев не выполняется вручную, для этого должны применяться специальные пакеты программ статистической обработки данных, предназначенные для аналитической работы. Такие программы используются зарубежными специалистами при анализе уже достаточно длительное время и с большим успехом.