С приездом на ИФФ ТГУ А. И. Данилова были заложены основы для складывания третьего научного направления в области медиевистики, теоретических проблем истории, историографии, истории исторической мысли и критики немарксистской («буржуазной» по терминологии тех лет) историографии. Он развивал в Томске основные положения московской научной школы медиевистов и методологов, возглавляемой профессором А. И. Неусыхиным. Изначально А. И. Данилов стал разрабатывать ряд вопросов по истории Средних веков. По этой теме он опубликовал большую работу «К вопросу эволюции фогства как одной из форм права феодальной собственности» (Труды ТГУ. 1948. Т. 103). Работа была написана на основе его кандидатской диссертации «Основные черты иммунитета и фогства на церковных землях в Германии X–XII вв.», защищенной в 1947 г. в совете МГУ. Вскоре после приезда в Томск А. И. Данилов обратился к историографической проблематике, ставшей главной во всей его дальнейшей научной деятельности. Он сконцентрировался на изучении немецкой историографии раннего западноевропейского Средневековья. Основные положения данной темы были опубликованы в его монографии «Проблемы аграрной истории раннего средневековья в конце ХIХ – начале ХХ в.» (М., 1958), которую в том же году он защитил в качестве докторской диссертации.
С переходом С. С. Григорцевича из ТомГПИ в первой половине 1950-х гг. в ТГУ стало зарождаться четвертое научное направление, в рамках которого со временем сложилась самостоятельная школа истории международных отношений. Область научных интересов сложилась еще во время его работы в Томском пединституте – международные отношения в дальневосточном регионе в конце XIX – начале XX в. Исследования этих вопросов стали возможны благодаря тому, что еще в годы войны в Томске был создан ЦГА РСФСР ДВ. В ТомГПИ еще на рубеже 1940–1950-х гг. кафедрой всеобщей истории совместно с кафедрой истории СССР под руководством С. С. Григорцевича было выработано несколько комплексных направлений исследовательской работы. Первая наиболее крупная тема – «Японо-американская интервенция на русском Дальнем Востоке и ее разгром (1920–1922 гг.)». Эта тема включала в себя несколько частных сюжетов: «Империалистическая интервенция на русском Дальнем Востоке в 1918–1919 гг.» (29 июня 1951 г. в ученом совете Института востоковедения АН СССР С. С. Григорцевичем была защищена кандидатская диссертация «Разгром японской интервенции и крах происков американских империалистов на советском Дальнем Востоке (1920–1922 гг.)»); «Экспансия японского капитала на русский Дальний Восток»; «Экспансия американского капитала на русский Дальний Восток»; «Формирование Дальневосточной республики и ее внешняя политика»; «Героическая борьба трудящихся под руководством партии большевиков против интервентов и белогвардейцев». К этим темам примыкала еще одна – «Присоединение к России, начало экономического освоения Амурской области и Уссурийского края и политика крупнейших капиталистических держав на Дальнем Востоке»[266]
.С 1953 г. группа археологов ИФФ ТГУ совместно с сотрудниками Музея ИМК ТГУ начали (точнее сказать, продолжили после перерыва, когда из ТГУ ушли профессора К. Э. Гриневич и А. П. Дульзон) систематические археологические исследования в окрестностях Томска и на территории самого города. В первой половине 1950-х гг. группа археологов ТГУ начала вести археологические раскопки в бассейне р. Томи, чтобы лучше изучить население, жившее в III–II тыс. до н. э. в окрестностях города. Исследованию были подвергнуты археологические памятники неолита и ранней бронзы, а также средневековое население этих территорий до прихода русских поселенцев. В это же время начинаются раскопки непосредственно в самом Томске – на Воскресенской горе, на Томском могильнике и в других местах. Они проводились под руководством заведующего Музеем ИМК и преподавателя ИФФ В. И. Матющенко вместе с доцентом Г. В. Трухиным[267]
. Во второй половине 1950 – первой половине 1960-х гг. ареал раскопок на территории Томской области значительно расширяется. Кроме окрестностей Томска и Томского района, в него были включены северные районы Томской области. Археологи начали изучать погребения второй половины II тыс. до н. э., характеризовавшие процесс становления культуры поздней бронзы в лесостепном Приобье (Среднеобская археологическая экспедиция)[268].С переходом в середине 1950-х гг. из Сталинского пединститута на кафедру всеобщей истории ТомГПИ старшего преподавателя Г. И. Пелих были заложены основы для исследований по этнографии народов Сибири и Дальнего Востока. Она стала изучать коренные народы этих регионов, прежде всего селькупов, хантов, шорцев, карагасов и др., ее комплексная тема – «Общественный строй селькупов Нарымского края в конце XIX – начале XX в.»[269]
. В 1954 г. в совете Института этнографии АН СССР им. Н. Н. Миклухо-Маклая она защитила кандидатскую диссертацию «Территориальная община у селькупов Нарымского края конца XIX – начала XX в.».