В 1964 г. все контракты по «Комете» были выполнены и ее серийное производство завершено. В итоге за 15 лет было выпущено 111 самолетов различных модификаций, включая прототипы (без учета «двоек», оставшихся на хранении, одного планера «четверки» для испытаний и двух для разработки «Нимрода»). А 17 мая 1964 г. скончался лорд Брабазон, во многом благодаря деятельности которого и был разработан этот самолет.
24 ноября 1965 г. посадкой в лондонском аэропорту «Хитроу» завершилась эксплуатация последней «Кометы»4 BOAC (per код G- APDM), прибывшей из Новой Зеландии. Интересно, что последний рейс самолета этого типа в составе ВОАС было доверено выполнить Р.Алабастеру, который, еще будучи вторым пилотом, вместе с Меджинди открыл на «Старине Питере» регулярную эксплуатацию «Кометы»I в мае 1952 г. Необходимо отметить и то, что за весь период эксплуатации с 1958 г. корпорация не имела катастроф с самолетами этого типа и все 19 машин благополучно продала другим авиакомпаниям (семь – «Дэн Эйр Сервисез», пять – «Малайзия-Сингапур Эйрлайнз», по две приобрели авиакомпании МЕА, «Мексикана» и «Аеровиас Экваторианас» и одна досталась «Кувейт Эйрвейс»). В итоге, ВОАС осталась самым крупным эксплуатантом новых «Комет»4, владея в разное время 28 самолетами различных модификаций (19 Мк.4, девятью Мк. 1), а также по одной Mk.1 А, Мк. 1ХВ и Мк.2Е. Незадолго до вывода «Комет»4 из эксплуатации ВОАС, 21 мая 1965 г., почти через год после смерти лорда Брабазона скончался основатель и бессменный глава фирмы-разработчика «Кометы» сэр Джефри де Хэвилленд, отдавший этому самолету более 20 лет жизни.
ВЕА же продолжала эксплуатировать свои «Кометы»4В, но с поступлением «Трайдентов» переводила их на менее престижные маршруты (в частности, в мае 1966 г часть «Комет» была переведена на внутреннюю линию Лондон-Глазго). Всего авиакомпания потеряла два самолета этого типа. Первая «Комета»4В (per. код G-ARJM) разбилась 21 декабря 1961 г. после взлета с Анкары, в результате чего погибло 27 человек. Обстоятельства же гибели второго самолета 12 октября 1967 г. настолько напоминают события, связанные с катастрофами 1954 г., что заслуживают отдельного изложения.
В этот день «Комета»4В (per. koaG-ARCO) с 59 пассажирами и семью членами экипажа на борту совершала перелет по маршруту Лондон-Никозия (о.Кипр) с промежуточной посадкой в Афинах. После взлета с аэропорта Афин этот самолет в 07:00 встретился на высоте 9000 м над Средиземным морем с другой «Кометой»4В ВЕА, командир которой впоследствии сообщил о нормальных метеоусловиях в этом районе маршрута. В 07:18 с борта G-ARCO было послано последнее сообщение в аэропорт Никозии. Три часа спустя плавающие обломки лайнера были обнаружены в 150 км юго-восточнее о.Родос, где глубины достигают порядка 1800 м. Тем не менее даже то, что удалось выловить позволило однозначно установить, что на борту самолета ориентировочно в 07:25 произошел взрыв бомбы, в результате чего «Комета» сначала потеряла управление, а затем на высоте около 5000 м развалилась на две большие части. Таким образом, спустя 13 лет история повторилась вновь, и как знать не было ли злого умысла и в той апрельской катастрофе 1954 г.
Оставшиеся 12 самолетов добросовестно работали под флагом ВЕА практически до конца 60-х годов, после чего их продали чартерным авиакомпаниям, где они еще долго летали на различных линиях. Кстати, в 1972 г. ВЕА и ВОАС объединились в финансовом плане, а в 1974 г. и организационно, образовав одну из самых крупных авиакомпаний мира «Бритиш Эйруэйс» (ВА), руководство и персонал которой настолько привык к «Боингам», что именно они, а не авиалайнеры европейского концерна «Эрбас», составляют сейчас основу ее флота.
Что касается военных «Комет», то самолеты модификации Мк.1ХВ использовались Королевскими канадскими ВВС до конца 60-х в качестве VIP-траспорта, а позже в качестве скоростных учебных целей для тренировки перехватчиков, изображая на учениях советские стратегические бомбардировщики-ракетоносцы Ту-95. Последняя из них согласно официальным данным была пущена на слом в сентябре 1973 г. Впрочем, уцелела одна из британских машин этого типа.