На Целии Гонорий реставрировал базилику Sanctorum Quatuor Coronatorum, которая уже при Григории Великом существовала как церковь-титул. Она находилась в квартале Caput Africae и была построена на развалинах какого-то древнего здания; прекрасные до сих пор колонны портика и вделанная в стену часть архитравы храма не оставляют сомнения в том, что на постройку этой церкви были употреблены древние памятники. Четыре венценосца погибли мученически во времена Диоклетиана и были comicularii или офицерами низшего ранга. Имена их были Север, Северин, Карпофор и Викторин. Целий был избран местом церкви имени этих святых, вероятно, потому, что здесь были расположены castra peregrina. То, что было построено собственно Гонорием, уже исчезло при последующих неоднократных реставрациях; высокие средневековые стены этой прекрасной церкви производят теперь впечатление замка и вместе с развалинами aqua Claudia и великолепной ротондой Св. Стефана придают Целию величественный вид.
Гонорием же построена также церковь S.-Lucia на Каринах, прозванная in Siliсе от улицы, выстланной базальтовыми многоугольными плитками. Церковь эта называлась также in Orphea, вероятно, по имени древнего фонтана lacus Orphei, который, по указанию Марциала, находился здесь. По-видимому, она была построена Гонорием совсем заново. Вне Рима Гонории также проявлял деятельность: он построил церковь Св. Кириака на via Cstiensis, у седьмого верстового камня, и церковь Северина близ Тиволи и реставрировал до основания знаменитую базилику Св. Агнессы за porta Nomentana.
Эта святая была римлянка патрицианского рода и окончила свою жизнь мученической смертью, имея только 13 лет от роду. Ее безнадежно полюбил и смертельно тосковал о ней сын префекта города Симфрония; отец стал убеждать молодую девушку спасти его измученного любовью сына. И Агнеса тогда призналась, что она христианка. Затем, когда она отказалась принести жертву Весте, префект приказал отвести ее под одну из арок цирка Agonalis, где, как и при всех других местах Для зрелищ, имели обыкновение собираться гетеры. Но незримые ангелы прикрыли невинную девушку своими длинными волосами; небесный свет изгнал из помещения ворвавшихся в него спутников влюбленного, и сам он пал бездыханным на пороге. Возвращенный затем девушкой по просьбе отца к жизни, сын префекта стал прославлять христианского Бога. Тогда жрецы присудили Агнессу к смерти как волшебницу, пламя костра, однако, не коснулось ее, и палач отрубил ей голову. Предание говорит, что это происходило 21 января 303 г.
Юная святая была погребена в имении своих родных, за Номентанскими воротами, и еще поныне там можно видеть будто бы принадлежащий ей мраморный саркофаге изображениями Океана, Геи, Эрота и Психеи. Затем имя св. Агнессы настолько прославилось, что в честь ее была построена церковь, и именно на этом месте катакомбы тянутся на большом протяжении. В одной древней надписи значилось, что первоначальная надгробная церковь была построена римлянкой Константиной; позднее ее возобновил епископ Симмах. Спустя менее чем 100 лет Гонории нашел церковь настолько разрушенной, что пришлось строить ее заново. Хотя позднее эта церковь подвергалась еще многим переделкам, тем не менее она является действительно созданием Гонория и служит одним из лучших памятников этого папы. Подобно древней надгробной церкви S.-Lorenzo, церковь Св. Агнессы помещается в глубине на краю долины, которая тянется от Номентанской дороги к Саларской; вследствие этого в церковь приходится спускаться по лестнице, имеющей 47 ступеней. Своими размерами церковь не велика, но они так прекрасно согласованы между собою, что здание это делает честь строительному искусству своего времени. В церкви два ряда поставленных друг над другом романских колонн, и верхний ряд образует хоры. Прекрасная работа и фригийский мрамор колонн свидетельствуют, что они взяты из какого-нибудь древнего памятника. Воздвигнутой Гонорием над исповедальней большой скинии из позолоченной бронзы уже не существует, но мозаика абсиды, сделанная по золотому фону, все еще остается памятником своего времени и уже падавшего тогда искусства. Мозаика изображает три фигуры; все они шаблонны и безжизненны, но производят приятное впечатление своей наивной простотой. Посреди стоит Агнеса; ее худощавая фигура, окутанная в разукрашенные по восточному одежды, уже приближается к византийскому стилю; голову окружает сияние; лицо лишено света и теней. Над головой святой простерта рука Бога, держащая венец; у ног лежит меч палача, а по обеим сторонам подымается пламя. Справа представлен Гонории, подносящий изображение церкви; слева стоит другой епископ, может быть, Симмах или Сильвестр; оба одеты в темно-коричневые plauetae и паллии; их обритые головы не покрыты папскими тиарами и не окружены сиянием. Внизу под мозаикой можно еще прочесть древние стихи, одни из лучших того времени; они, без сомнения, художественнее, чем то изображение, которое прославляется ими: