Климент оказался даже не в состоянии прекратить вопиющее злоупотребление – держать в течение долгих лет в невозможных тюрьмах узников, не признанных виновными и не осужденных. Инквизиторы сохраняли в своих архивах буллу Иннокентия IV, разрешавшую им до бесконечности откладывать произнесение приговора, если они находили подобную отсрочку полезной для дела веры; они широко применяли эту буллу. Когда один из кардиналов посетил епископскую тюрьму, то в ней оказалось много арестованных альбигойским епископом еще в 1299 г. и все еще ждавших суда; в 1310 г. граждане Альби жалуются папе, что более восьми лет сидят в тюрьме в предварительном заключении и умоляют его приказать рассмотреть их дела. Климент приказал немедленно окончить дела и приговоры представить на утверждение кардиналов, его прежних комиссаров. Епископ Альби и Жофруа д'Абли упорно не исполняли эти приказы. О непреклонном упорстве инквизиции свидетельствует дело Гильема Гаррика, посаженного в тюрьму еще в 1284 г. по обвинению в заговоре, целью которого было уничтожить списки каркассонской инквизиции. Из королевских грамот, помеченных 1312г., известно, что Климент V, принимая во внимание заслуги и благочестие заключенного, дарует ему полное прощение, а король вследствие этого возвращает Гаррику и его потомкам замок Монтебра, ранее этого конфискованный. Инквизиция не исполнила повеления папы и короля до 1321 г.; затем она вывела заключенного из тюрьмы, и инквизитор Бернар Ги, ввиду сердечного раскаяния старца, ограничился тем, что приговорил его к пожизненному изгнанию, обязав в тридцатидневный срок покинуть Францию.
Однако усилия ограничить инквизицию, предпринятые Климентом, не были безрезультатными. По настоянию папы Виеннский собор 1312 г. редактировал пять книг канонического права- «Клементин», которые были официально изданы только 25 октября 1317 г. Иоанном XXII. Вошедшие в них каноны были направлены к ограничению произвола инквизитора и требовали епископского участия при применении пытки и строгого заключения, равносильного пытке, а также касались управления тюрьмами. Отлучение от Церкви грозило тем, кто будет злоупотреблять своей властью из личной вражды, дружбы или алчности.
Хотя избранный в 1316 г. новый папа Иоанн XXII опубликовал «Клементины», но он же скоро показал, что инквизиторам нечего его бояться; и они поспешили удовлетворить свою старинную ненависть. Их первой жертвой был Бернар Делисье. Во время папства Климента и во время междупапствия Бернар жил в покое и мог думать, что уже позабыли о его горячей защите народных интересов в Лангедоке. Но его обвинили в том, что он мешает деятельности инквизиции, тотчас арестовали и предъявили против него ряд других обвинений: он чародейством наслал смерть на Бенедикта XI и изменил во время каркассонского дела. Папа назначил особую комиссию для расследования виновности Бернара, который в течение двух лет находился в строгом заточении. Суд в составе тулузского архиепископа и епископов Памье и С.-Папуля собрался в Кастельнодари только 3 сентября 1319 г., но 12 сентября перенесли суд в Каркассон. Папа прислал на суд своего представителя в лице инквизитора Жана де Бона, представителем короля явился сенешаль Тулузы и Каркассона, также присутствовали епископ Ланский и граф де Форез.
Известные сподвижники Бернара были приведены на суд, чтобы подвергнуться допросу одновременно с главным обвиняемым и быть свидетелями против него. Им обещали оставить жизнь, если их показания, данные под присягой, поведут их друга к гибели. Престарелый Бернар, разбитый двухлетним тюремным заключением и долгим следствием, в течение двух месяцев подвергался самому строгому допросу. Ему припомнили старые дела, бывшие 12-18 лет тому назад, и, чтобы сбить его, искусно примешивали в факты различные выдвинутые против него обвинения. Ему неоднократно объявляли, что он еретик, так как более года находился под отлучением от Церкви за обструкцию инквизиции. Только безусловное подчинение и полное и искреннее признание могли спасти его от костра. Два раза подвергали его пытке; первый раз 3 октября по обвинению в измене; второй раз 20 ноября по обвинению в некромантии. Но двукратное применение пытки не вырвало у него признание. Однако его сумели довести до того, что он стал противоречить сам себе и обвинять самого себя, так что в конце концов был вынужден смиренно просить прощения.
Приговор был вынесен 8 декабря: по обвинению в колдовстве против Бенедикта XI Бернар был оправдан, но остальные обвинения были еще отягощены семьюдесятью клятвопреступлениями во время допроса. После отреченья от своих заблуждений он получил отпущение грехов, был лишен духовного звания и приговорен к пожизненному тюремному заключению в каркассонской тюрьме на хлеб, на воду и в цепях. Через несколько месяцев смерть унесла единственного человека, который осмеливался вести открытую борьбу против инквизиции.