Гуситские идеи быстро распространялись по Германии, благодаря глубокому отвращению, которое внушало к себе неисправимо развращенное духовенство. Церковь могла ожидать всеобщего восстания. Единодушно поддержанный всем христианским миром к северу от Альп, собор оказал решительное сопротивление папе. Сигизмунд принял сторону собора и в ноябре 1432 г. объявил, что берет под свою защиту отцов собора. Евгений в феврале 1433 г. согласился предоставить собору свободу действий. Но в июле снова объявил роспуск собрания и в сентябре подтвердил это. Собор приступил к суду над папой, и в декабре Евгений отменил свои буллы. Когда же снова вспыхнула ссора, то собор в январе 1439 г. отстранил папу, в июне низложил его, а в ноябре того же года избрал на его место Амедея Савойского под именем Феликса V.
Тем временем шли переговоры между собором и гуситами; на совещании 18 мая 1432 г. в Эгере было установлено, что разногласия будут обсуждаться на основании авторитета Св. Писания и творений древних отцов Церкви. Четыре положения, представлявшие общее основание учений утраквистов и таборитов, были приняты как резюме их требований и легли в основу споров, которые велись в Базеле, в Праге, в Берне и Штульвейссенбурге вплоть до окончательного совещания в Иглау в июле 1436 г. Часто споры принимали бурный характер. Когда Иоанн Рагузский, говоря о гуситах, употребил слово еретики, то Ян Рокицана, один из делегатов утраквистов, потребовал, чтобы всякий, кто выдвинет подобное обвинение, был обязан подтвердить это под угрозою наказания. Представитель таборитов Прокоп присоединился к этому протесту и заявил, что он никогда не пришел бы в Базель, если бы знал, что подвергнется подобному оскорблению. Иоанн Рагузский и лионский архиепископ должны были извиниться. Пригласили гуситов принять участие в соборе, но они не попались в эту ловушку.
Чехи заставили официально признать свои четыре положения под названием Compactata («Сжатое изложение»). 26 ноября 1433 г. в Праге был заключен договор об этом. Но это соглашение не разрешало всех затруднений. Четыре положения были лишь кратким изложением веры и допускали бесконечно разнообразные толкования. Диалектикам собора не трудно было разбить их и лишить всякого практического значения. С другой стороны, гуситы могли легко развивать их так, чтобы оправдать свои требования. В сущности, дело было так мало улажено, что в апреле 1434 г. собор обложил весь христианский мир половиной десятинного сбора для организации крестового похода против гуситов.
Когда в январе 1434 г. легаты покинули Прагу, между таборитами и утраквистами поднялись споры по поводу последствий переговоров. Между обеими сектами существовало, кроме религиозного, и политическое различие. Табориты в большинстве были крестьяне или бедные люди. Они не хотели принимать в свои ряды ни баронов, ни дворян, желали к четырем основным положениям прибавить еще два, чтобы обеспечить Чехии независимость и вернуть все конфискованные имущества. Разногласия между двумя партиями дошло до крайности, и они прибегли к оружию.
Табориты осаждали Пльзень, принявший сторону Сигизмунда, когда в Новом-Граде в Праге двадцать две тысячи их последователей были вырезаны без разбора пола и возраста. Они сняли осаду и 9 мая отправились к Праге, чтобы отомстить городу; но лишь появившись под стенами Праги, пошли в Моравию. Между тем, утраквисты заключили союз с католическими баронами, которые, щедро одаренные собором, дали еретикам сильное подкрепление. Столкновение произошло в воскресенье 30 мая около Липан. Весь день и всю ночь тянулась ожесточенная битва, кончившаяся только в три часа утра в понедельник. Прокоп и тринадцать тысяч таборитов остались на поле битвы. Резня была настолько ожесточенной, что в плен взяли меньше ста человек. Могущество таборитов было окончательно сломлено.
Правда, они сохраняли еще за собою гору Табор, пока не были полностью уничтожены Юрием Подебрадом в 1452 г. Но и после почти полного уничтожения таборитов оставалось много поводов к ссоре. Так что в августе 1434 г. стали готовиться к новому крестовому походу. Compactata были официально подписаны 5 июля 1436 г., но мир, заключенный при взаимном недоверии и условия которого поддавались прямо противоположным толкованиям, не мог уладить глубокие разногласия.
Когда Сигизмунд прочно укрепился на чешском престоле, обряды и церемонии римской Церкви вновь заменили господствовавшую в течение двадцати лет церковную службу, отрицавшую всякую пышность.