Рядом с бывшим домом графа Воронцова, построенном Растрелли и подаренном Павлом I Ордену с названием "замок мальтийских рыцарей", архитектором Джакомо Кваренги была построена католическая церковь (капелла) во имя святого Иоанна Крестителя Иерусалимского, освященная 17 июня 1800 г. митрополитом римско-католической церкви в России Сестренцевичем. Для нее по проектам Кваренги были изготовлены трон Великого Магистра, светильники, разная утварь. Там же помещались казна, канцелярия Ордена и помещения для руководителей Ордена.
В январе 1799 г. в Адмиралтействе на одном из бастионов был возведен мальтийский павильон, открытие которого было отмечено 33 орудийными залпами.
На Каменном острове был построен странноприимный дом для 50 инвалидов с церковью святого Иоанна и выделено место для кладбища при ней для погребения мальтийских рыцарей.
Для награждения отличившихся военными подвигами офицеров Павел I учредил 20 командорств.
Для обеспечения постоянного существования Ордена в России Император Павел I учредил своим Указом 98 Родовых Командорств (в соответствии со статьей XXIII Конвенции 1797 г.), членами которых стали члены самых аристократических семейств России.
После утверждения правил по принятию русского дворянства [68, № 18859] хлынул поток желающих стать кавалерами Ордена. "Столица была наводнена настоящим дождем Мальтийских крестов", — писал Ф. Головкин [114]
. Как обычно, начались злоупотребления. Поэтому Павел ограничил прием в Орден. 21 июня 1799 г. публикуются "Высочайше утвержденные Правила для учреждения родовых Командорств или Jus patronatus в России" (см. Приложение № 14), по которым право назначать фамильные командорства является исключительно прерогативой Императора.Для вступления в Великое Приорство Российское православному необходимо было представить доказательства, что данная семья принадлежит к наследственной аристократии "по крайней мере, сто пятьдесят лет" [115]
. В Правилах разъясняется, каким образом можно вступить в наследование родовым командорством (этот вопрос важен также потому, что многочисленные псевдоордена", появившиеся в XX веке, обосновывают свою легитимность понятием "наследственные командорства", ссылаясь на вышеупомянутые Правила, хотя даже определения термина "наследственные командорства" в этих Правилах нет).В статье 5-й Правил указано:
"Понеже родовые Командоры по Статутам Ордена подвержены тем же обязанностям, как и Командоры по старшинству, то и никто из назначенных к наследству в родовом командорстве не может вступать в права оного, доколь не исполнит всего по сему предмету предписанного; почему он и должен:
1). Доказать, что он точно тот самый, который по положенному в акте порядку к наследству в том командорстве назначен;
2). Быть по правилам приняту, заплатя за прием по обыкновению, но, не делая новых о Дворянстве доказательств, ибо полагается, что при учреждении командорства фамилия его уже оные представила;
3). Иметь, по крайней мере, 5 лет старшинства в Ордене, что и заменит те 5 лет пребывания, к коим обязаны были в Мальте.
NB. Старшинство Кандидата начнется токмо с того дня, когда докажет он законное и прямое свое происхождение по мужеской линии от фамилии учредителя и когда внесет пошлины за прием.
4) Прослужить, по крайней мере, два года в воинской Его Императорского Величества службе и достичь до Офицерского чина, что и заменит предписанные караваны" [116]
.