3 августа прекратили работу строители, затем — грузчики и печатники. Бастовало более 3000 человек. Забастовка была подавлена чехословацкими отрядами (см. док. 16 из «Хрестоматии…»).
ЦК РКП (б) придавал огромное значение сибирскому большевистскому подполью. Для «руководства и организации партийной нелегальной работы» в Тюмени, еще до ее падения, было создано Оргбюро РКП (б), позднее переехавшее в Томск.
Оно провело в сентябре 1918 г. нелегальную конференцию в Томске, на которой присутствовал и делегат Новониколаевска.
Конференция призвала большевиков сосредоточить силы на подготовке всеобщего вооруженного восстания, не допуская разрозненных, обреченных на поражение стихийных выступлений.
На основе решений конференции избранный ею подпольный обком РКП (б) разработал развернутую программу партизанской войны, которая в виде листовки была распространена в городах и селах.
В сентябре состоялась первая нелегальная конференция большевиков Новониколаевска, обсудившая директивы обкома РКП (б). Она утвердила подпольный городской комитет и создание трех партийных организаций, начавших подготовку к восстанию.
Однако белогвардейской контрразведке удалось выследить боевую группу, организованную братьями Кепп — Александром, Николаем, Михаилом и Владимиром. Были схвачены 30 дружинников, 20 из них, в том числе Александр и Михаил Кепп, расстреляны, остальные сосланы на каторгу.
Несмотря на жесточайшие преследования и многочисленные аресты, к весне 1919 г. в большевистской организации состояло более ста человек и она продолжала расти. Большевики Новониколаевска установили связь с подпольными группами в селах, с солдатами гарнизона, создали и возглавили несколько партизанских отрядов в Приобье. Влияние их увеличивалось с каждым днем. Возродились и включились в борьбу большевистские организации в Каинске, Барабинске, Татарске.
В декабре 1918 г. было создано Сибирское бюро ЦК РКП (б), которое координировало действия подпольных организаций, снабжало их деньгами, укрепляло кадрами. Перед отъездом в Сибирь некоторые партийные работники встречались с В. И. Лениным, инструктировавшим их. По поручению В. И. Ленина Я. М. Свердлов постоянно следил за деятельностью сибирского подполья. «Мы ни на минуту не забываем о вас, — писал он в одном из писем, — посылали неоднократно деньги — мало — не по нашей вине… внутренне мы крепче, чем когда-либо. Возможны временные неудачи, но значения они не могут иметь. Мы победим. Установим прочную связь, и работа пойдет полным ходом».
Летом и осенью 1919 г. сибирское подполье вновь подверглось кровавым ударам. Были захвачены и убиты руководители каннских большевиков, в Новониколаевске казнены Е. Б. Ковальчук, А. Ф. Шамшина и многие другие. Но павших сменяли новые и новые бойцы, продолжавшие их дело.
Белогвардейский переворот основная масса крестьян встретила настороженно, а беднота открыто заявляла о своих симпатиях большевикам. Уже первые мероприятия белогвардейского контрреволюционного правительства вызвали всеобщее недовольство, которое все нарастало. Крестьяне возмущались насильственным разгоном Советов, вмешательством чехословаков во внутренние дела русских, восстановлением царских налогов и взиманием недоимок за годы войны, запрещением пользоваться казенными лесными дачами, ликвидацией земельных комитетов, ответственных за осуществление ленинского декрета о земле.
Насильственная мобилизация молодежи для крайне непопулярной войны с Советской Россией вызвала в ряде волостёй волнения, подавленные карательными отрядами. Уже в июле 1919 г. В. И. Ленин отмечал, что основная масса сибирских крестьян, «самых сытых», «наименее большевистских», вступила в конфликт с буржуазно-эсеровской властью.
Вскоре после антисоветского переворота в селах стали возникать подпольные группы сочувствующих Советской власти. Их создавали большевики, члены первых Советов, революционно настроенныё солдаты-фронтовики, красногвардейцы и рабочие. К весне 1919 г. они действовали во многих селах. Повсеместно развернулась огромная работа по подготовке всеобщего крестьянского восстания, которое предполагали начать летом, когда Красная Армия подойдет к Тоболу.
В июне 1919 г. начались волнения крестьян Томской и Тобольской губерний, переросшие в Урманское восстание, охватившее 56 волостей. 10 июля, по заранее намеченному плану, выступило большинство волостей Татарского, Тарского и Каннского уездов. Восставшие объявили о свержении колчаковского режима как насильственно навязанного народу» разогнали белую милицию и кулацкие дружины, ликвидировали земские управы и создали революционные органы власти. На территории Партизанского края была проведена запись добровольцев и мобилизация мужчин, что позволило сформировать пять крупных отрядов (армий).