В 1448 г. Афонсу взял власть в свои руки, и высшая знать захватила господство в стране, продлившееся до конца этого царствования. Бывший регент и все его сторонники подверглись преследованиям. В 1449 г. Педру собрал своих людей и в сопровождении небольшого войска отправился в Лиссабон. Он ехал, по его словам, чтобы оправдаться от несправедливых обвинений, выдвинутых против него, а по утверждениям его противников, он стремился прорваться в столицу, чтобы при поддержке народа выступить против короля. Второе предположение стало решающим: войско короля вышло ему навстречу, и в битве при Алфарробейре инфант был убит вместе с большим числом своих сторонников.
В этом своем последнем выступлении дон Педру не имел за собой поддержки народа. Мастеровые Лиссабона, десять лет назад провозгласившие его регентом и взявшиеся за оружие, чтобы его защитить, оставались в 1449 г., судя по всему, безучастными к конфликту. Нет также сведений о реакции на эти события на местах в каком-либо районе страны. Трагедия Алфарробейры выглядит скорее как сведение счетов, чем как гражданская война. Триумф высшей знати был полным.
Афонсу V
Вторая половина XV в. до конца правления Афонсу V отмечена политикой в интересах высшей знати: большие пожалования, создание новых титулов, огромный рост штата придворных, исполнение государственных должностей представителями высшей знати, рост пенсий и бенефициев, которые перераспределяли доходы казны в пользу сеньоров, частые военные предприятия.
За эту политику принято обвинять Афонсу V. На самом деле знать, использовав в 1449 г. молодого короля для подавления противостоящей партии в лице дона Педру, уже многое имела, когда король вступил на престол. Она укрепилась и в значительной степени добилась влияния в период реформ государства, последовавший за революцией 1383— 1385 гг. Развитие экономики наряду с нехваткой подготовленных к административной деятельности кадров среднего класса позволило знати, казалось бы побежденной в ходе революционных событий, извлечь основные преимущества из политики централизации и укрепления королевской власти, проводившейся в первой половине века.
Большие военные предприятия начались в 1458 г. В 1453 г. турки захватили Константинополь, что вызвало в Европе большое потрясение; именно эта дата была избрана в качестве вехи, отделяющей Средневековье от Нового времени. Экспансия турок в направлении Центральной Европы продолжалась, и в 1456 г. они осадили Белград. Папа приказал тогда проповедовать крестовый поход против неверных. Европа осталась глуха к этому призыву, но Афонсу V с воодушевлением воспринял его. Он уведомил папу, что в течение года за свой счет подготовит войско в двенадцать тысяч бойцов и выступит с ним против турок. Несмотря на общее неодобрение, вызванное этой инициативой, подготовка началась немедленно: закупалось оружие, корабли, чеканились золотые монеты, пригодные для хождения во всех христианских странах.
Но папа вскоре умер, осада была снята, и проект крестового похода вскоре оказался заброшен. Военные ресурсы, собранные к тому времени, были использованы в экспедиции на север Африки, закончившейся захватом Алкасер-Сегера (Эль-Ксар Эс-Сегир), маленького прибрежного городка между Сеутой и Танжером. После этого в Африку было совершено еще два больших военных похода под руководством короля: поход 1463—1464 гг., закончившийся неудачей под стенами Танжера, и поход 1471 г., когда была захвачена Арзила (Асила) и занят Танжер, который мавры сдали после потери Арзилы.
Африканские походы и благоволение короля к крупным сеньорам принесли Афонсу V большой авторитет среди португальской и испанской знати. Это побудило одну из группировок кастильской знати просить португальского короля о вмешательстве во внутренние дела соседней страны и о принятии кастильского престола.
Другая партия считала наследницей трона Исабель, сестру умершего короля Энрике (Генриха IV). Исабель же была замужем за наследником арагонской короны. Его восшествие на престол Кастилии означало объединение двух королевств и таким образом нарушение баланса сил, существовавшего между пиренейскими государствами. Афонсу V вторгся в Кастилию в 1475 г. и получил первоначально поддержку некоторых крупных феодалов страны. Но эта поддержка постепенно ослабевала. В 1476 г. произошла битва около города Торо. Португальские историки считают, что исход ее был неопределенным, а историки соседней страны говорят о решающей победе. Фактически битва при Торо означала конец притязаний португальского короля.
Корона в борьбе с крупными феодалами
Правление Жуана II (1481 — 1495) вызвало радикальные перемены в политической жизни.