Правда, очень скоро выяснилось, что глава казанцев Иван Биркин претендует на то, чтобы стать во главе всего ополчения. Он полагал, что Казань может стать самостоятельным государством, поскольку в Москве нет настоящей власти. Эти его планы полностью разделял оставшийся в Казани на воеводстве Никанор Шульгин. Но ополченцы не захотели быть под командованием Биркина. Поэтому с большей частью своего отряда он вернулся в Казань. В Ярославле остались лишь голова Лукьян Мясной, с ним 20 татарских князей и 30 дворян, а также стрелецкий голова Постник Неелов со 100 стрельцами.
В июне 1612 г. приехали из Первого ополчения 17 казачьих отрядов, в каждом из которых было от 75 до 200 человек. Казаки надеялись получить более твердое материальное обеспечение, чем в Подмосковном стане, где не хватало ни боеприпасов, ни продовольствия.
В то же время руководителям Второго ополчения приходилось вести бои с разбойничающими казаками из Первого ополчения. Они произошли около Кашина, в Пошехонье, под Угличем, у Переславля-Залесского. Всюду казаки были разбиты.
Хотя во Втором ополчении было много думных людей, Боярская дума не была воссоздана. Не было и Освященного собора. Но по совету троицкого архимандрита Дионисия в Ярославль был приглашен бывший ростовский митрополит Кирилл. Он был свергнут Лжедмитрием I, как ставленник Б.Ф. Годунова, и проживал на покое в Троицком монастыре. Заменивший его Филарет находился в польском плену, новгородский митрополит Исидор был в плененном шведами Новгороде, крутицкий митрополит убит, казанский митрополит Ефрем отказывался покидать свою епархию.
С февраля 1612 г., когда умер патриарх Гермоген, не выдержавший нечеловеческие условия содержания в земляной тюрьме Чудова монастыря, православная церковь оказалась без пастыря. Возглавить ее ополченцы поручили Кириллу.
Кирилл Завидов
Поход Второго ополчения к Москве
В июле 1612 г. в Ярославль прибыли посланцы от Д.Т. Трубецкого. Они сообщили о том, что к Москве вновь движется большое войско под командованием польского гетмана Ходкевича. Разбить его у Первого ополчения не было сил. Д.М. Пожарский тут же отправил к Москве отряд под командованием М.С. Дмитриева и Ф. Левашова, но при этом повелел им не входить в расположение войск Первого ополчения и расположиться у Петровских ворот. Он опасался провокаций со стороны казаков.
Вслед за первым отрядом был послан второй, более крупный. Его возглавили Д.П. Пожарский и С. Самсонов. Воеводам было поручено расположиться у Тверских ворот.
Наконец, в конце июля основное войско под командованием Минина и Пожарского выступило в поход. Пока оно двигалось по направлению к Ростову, Дмитрий Михайлович с небольшим сопровождением отправился в Суздаль, чтобы помолиться в Спасо-Евфимиевом монастыре. Получив благословение у местного архимандрита, он вернулся к основному войску.