В ходе противоборства двух группировок дворянской иерархии постепенно росло недовольство в широких слоях недворянского населения. В результате эпидемий, неурожаев и османских набегов на юге страны в начале XVI в. десятки тысяч крестьянских хозяйств подвергались разорению, что стало причиной роста миграции крестьян. Однако дворянство приняло закон, ограничивающий свободу передвижения феодально-зависимого крестьянства. Одновременно были приняты и другие меры, усиливавшие зависимость крестьян от помещиков и комитатского дворянства. Население частновладельческих городов, которое в XV в. возросло в результате бума в экспорте крупного рогатого скота и вина, было недовольно постановлением сейма, согласно которому им приходилось уплачивать землевладельцам девятую часть стоимости своей продукции вместо прежних фиксированных выплат. Именно в то время, когда в рядах феодально-зависимого крестьянства возобладали недовольство и отчаяние, эстергомский архиепископ Тамаш Бакоц получил от папы Льва X разрешение организовать крестовый поход (1514 г.). Массовое участие в походе зависимых крестьян грозило сорвать весенние полевые работы. К тому же дворян заботили вопросы их собственной безопасности, поскольку в рядах крестьян-крестоносцев живейший отклик вызывали идеи францисканских проповедников о крестьянском царстве, клерикальной бедности и равенстве собственности.
15 мая 1514 г. под давлением магнатов и дворян король и Бакоц отдали приказ о роспуске крестоносного войска. То, что последовало за этим, стало крупнейшей в истории Венгрии крестьянской войной. Повстанцы под предводительством мелкого дворянина-секея[39]
Дёрдя Секея (позднее источники называли его Дожа) нападали на дворянские имения и подвергали их разграблению. Кровавое сведение счетов с дворянством было логическим следствием ухудшения положения зависимых крестьян и хаоса в стране в годы правления Владислава И. В конце концов Запольский нанес поражение главным силам крестьянского войска в битве при Темешваре (совр. Тимишоара в Румынии. —Центральная власть, которая должна была защитить крепостных от деспотизма помещиков, в то время в Венгрии отсутствовала. После поражения крестьянской войны и смерти Владислава II (1516 г.) дворянская анархия только возросла. Людовик, которому едва исполнилось десять лет, лишь формально унаследовал отцовский скипетр в Венгрии и Чехии. До достижения им совершеннолетия страной управлял вице-регентский совет в составе трех человек. Однако состав этого совета не устраивал дворян — сторонников Запольского. На смену этому органу был избран регентский совет, состоявший из шести прелатов, шести магнатов и 16 дворян. Мелкому и среднему дворянству удалось на время продлить свое влияние в стране. Выражением их политических устремлений стала частная кодификация венгерского права, составленная Иштваном Вер-бёци, который на сейме 1514 г. представил свою работу
Несмотря на теорию единого дворянства, конфликты между основными группами дворян (так называемые национальная и придворная партии) усилились и обострились. Это становилось очевидным во время часто созываемых сеймов, по мере того как различные дворянские группировки или конфедерации принимали нередко противоречивые решения, которые только усиливали хаос в стране. По мере того как предводители дворянских группировок обогащались, королевская казна пустела. Казна пыталась спасти ситуацию путем чеканки монет с пониженным содержанием драгоценного металла. Обесценение денег — почти на две трети — вело к инфляции и социальной нестабильности.