На следствии Салтыкова всё отвергала. Даже духовник ничего от неё не добился. Об упорстве Салтыковой доложили Екатерине и попросили дозволения на пытку. Но императрица не согласилась. Несмотря на упорство Салтыковой, её признали виновной, лишили дворянского звания. Сначала над ней произвели гражданскую казнь: приковали к столбу на площади, повесив на шею доску со словами: «мучительница и душегубица». Потом её следовало, «заключа в железы, отвести в один из женских монастырей, находящихся в Белом или Земляном городе, и там посадить в подземную тюрьму, в которой по смерть её содержать, таким образом, чтоб она ниоткуда в ней свету не имела; пищу ей обыкновенную старческую подавать туда со свечою, которую опять у ней гасить, как скоро она наестся…»
На полях этого указа рукой Екатерины возле слова «она» поставлено «он». Императрица хотела сказать, что Салтыкова недостойна называться женщиной.
Итак, помещицу заключили в московский Ивановский женский монастырь. Просидела она там 33 года, сначала в склепе под соборной церковью, потом в застенке. Совершенно точно известно, что в заключении она родила от караульного.
По словам историка, «Салтыкова, когда бывало соберутся любопытные у окошечка за железною решёткою её застенка, ругалась, плевалась и совала лапку сквозь открытое в летнюю пору окошечко, обнаруживая тем самым закоренелое зверство, которого не погасили в ней ни раскаяние в злодействах, ни истома долговременного заключения в мрачном склепе». Умерла Салтыкова в 1800 году и похоронена в Донском монастыре, где погребалась вся её родня.
К сечению кнутом, вырыванию ноздрей и вечной ссылке в Сибирь.
Тайная экспедиция ведала также делами о самозванцах. Вёлся розыск по следующим делам: Елизаветы Таракановой, выдававшей себя за дочь Елизаветы Петровны (1775), в 1765 году беглого рекрута Евдокимова, украинца Колченко, беглого солдата Кремнева, капитана Кретова, солдатов Чернышёва и Сенюшина, в 1797 году – московского купца Петерикова, выдававших себя за Петра III. Кроме того, в 1784 году сына пономаря Зайцева, выдававшего себя за великого князя Павла Петровича, и купца Тимофея Курдюмова, выдававшего себя за принца Иоанна. Большинство самозванцев, дела которых рассматривались в Тайной экспедиции, были подвергнуты смертной казни, или наказанию кнутом, вырыванию ноздрей и ссылке в каторжные работы.
В 1772 году в конце войны против польских конфедератов вёлся розыск по делу полкового старшины запорожского войска Максима Высоцкого. Было установлено, что Высоцкий вступил в тайные сношения с конфедератами, дал им обещание склонить на их сторону запорожских казаков. Высоцкого лишили старшинского звания и сослали в Сибирь. В 1776 году в Тайной экспедиции проводился розыск по делу раскольника осташковского купца Исакова, отказавшегося по своим религиозным убеждениям дать «клятвенное обещание в верности императрице» после избрания его выборным для производства «соляного сбора». В отношении Исакова экспедиция не применяла своего метода «допроса с пристрастием». Вместо этого она широко использовала синодальных чиновников для его «увещевания», с тем, чтобы купец вернулся «в лоно истинной веры». Другим крупным делом, которым Тайная экспедиция занималась в связи с обвинением в государственной измене, было дело кригсцальмейстера Овцына, арестованного в Бердичеве в 1798 году за то, что собирался бежать из России.
А. Н.Овцын был одним из передовых людей своего времени, знаком с литературой просветителей XVIII века и занимался распространением запрещённой литературы. При аресте в его бумагах нашли значительное количество рукописных сочинений «вольных мыслей». Овцын, находясь в заключении, в ответ на политику Павла I и «строгостей», которые были им введены (запрещение собраний и съездов в частных домах, правила пользования экипажами, особенно порядков, введённых в судах и армии: «Здесь сего дня генерал, а завтра безмундирная бродяга»), дал интересный обзор современного ему положения в Польше, о состоянии денежного курса в России, указал на причины недовольства разных социальных групп общества: дворян, солдат, офицеров, купцов.
К записке была приложена написанная тем же Овцы-ным «диссертация народная» о перемене правительства.
Овцына приговорили к сечению кнутом, вырыванию ноздрей и вечной ссылке в Сибирь.
В последней четверти XVIII века в России появляются и работают замечай ельные просветители А.Н.Радищев, Н.И.Но-виков, В.ВЛопугаев, И.МБорн, Ф.В.Кречетов, В.ВЛассек. Власти относились к ним подозрительно. Екатерина назвала Радищева «бунтовщиком хуже Пугачёва».