Прибыв на берега лагуны в ноябре 1807 г., Наполеон I принимает ряд мер, направленных на оживление городской жизни: начинает портовые работы, отдает приказ о реставрации дамб
В 1811 г. генерал Лористон в своем докладе императору рисует весьма печальную картину сложившегося положения: всеобщее запустение, разорение знатных семейств, бросающих свои дворцы и дома, которые идут с молотка. При этом он еще умалчивает о грабежах и разбазаривании тысяч произведений искусства, принадлежавших разрушенным церквям, разогнанным конгрегациям и скуолам: масштаб бедствия был столь велик, что создание музея Академии и передача фондов библиотеке Сан-Марко не могли компенсировать ущерб.
В конце 1813 г. Венецию осаждают австрийцы. В это время в городе находятся около 40 тыс. голодных и обнищавших жителей. Перемирие, подписанное 16 апреля 1814 г., передает разграбленный город под власть Австрии.
3 мая 1815 г. представители венецианских провинций, собравшись на площади Сан-Марко, приносят присягу на верность императору Францу I, который 31 октября торжественно вступил в Венецию. Провинции объединяются в Ломбардо-Венецианское королевство под властью вице-короля: столицей королевства становится Милан, а в Венеции остается кассационный суд и штаб командующего военно-морским флотом.
В 1819 г. в своем отчете императору вице-король по-прежнему говорит о руинах Венеции, брошенных дворцах и многочисленных нищих и безработных. Отток жителей из города продолжается, а Триест составляет жесткую конкуренцию венецианскому порту. С 1813 по 1818 г. население города сократилось на 12 тыс., а общее число жителей составило менее 100 тыс. человек. В 1825 г. Торговая палата отмечает, что порт фактически пребывает в запустении. В 1827 г. наблюдается значительное сокращение текстильной продукции: шерсти, шелка и хлопковых тканей.
Оживление экономики наступает довольно поздно. Только в 1830 г. Венеция и ее порт получают статус зоны свободной торговли. В 1837 г. создается общество для постройки железной дороги между Миланом и Венецией; в 1841 г. заложен первый камень железнодорожного моста, который свяжет город с материком; в январе 1846 г. в Венецию прибыл первый поезд. Создана новая коммерческая компания, ставящая своей задачей развитие морской торговли, а также речного судоходства между Миланом и Венецией. Принята программа строительства новых судов. Однако при всей энергичности венецианцев Милан — благодаря гибкости и динамичности своей элиты — в целом значительно опережает Венецию.
Вторая республика
В 1814–40 гг. отношения между венецианцами и австрийцами складываются в целом неплохо, доказательством чему служит тот факт, что движение карбонариев, активизировавшееся в 1820–21 гг. в Полезине, Вероне и Виченце, не затронуло Венецию.
К 1840 г. созревает зародившийся в кадетской морской школе антиавстрийский заговор; во главе заговорщиков стоят сыновья контр-адмирала Аттилио и Эмилио Бандьера. В 1844 г. после провала попытки восстания обоих казнят неподалеку от Козенцы.
Легальное сопротивление оккупантам возглавил адвокат Даниэле Манин. В свою программу Манин включает требование уважения прав населения Ломбардии и Венето на самоуправление, сохранения его институтов и традиций. Писатель Никколо Томмазео оказывает Манину активное содействие. Вернувшись из изгнания, он в декабре 1847 г. выступает в Венеции с речью, в которой требует отмены цензуры и призывает к объединению Италии. Речь его заканчивается следующими словами: «И пусть имя Италии… звучит в душах подобно голосам наших милых и дорогих возлюбленных!»
19 января 1848 г. Манина и Томмазео арестовывают. В Венеции проходят демонстрации протеста против владычества Австрии; в Падуе вспыхивают студенческие волнения. Когда из Парижа приходит известие о начавшейся там революции, в Ломбардо-Венецианском королевстве объявляют о вступлении в силу закона военного времени.
17 марта собравшаяся на площади Сан-Марко толпа требует освобождения узников. Манин призывает к восстанию. 22-го вспыхивает мятеж в Арсенале, и австрийцы покидают город. Манин формирует правительство и становится его главой. Однако города Венето, следуя примеру Милана, голосуют за присоединение к Пьемонту, где правит Карл Альберт. Опасаясь австрийской интервенции, провинциальная ассамблея в июле принимает аналогичное решение. В августе комиссары из Пьемонта прибывают в Венецию, где их встречают без особого энтузиазма. Причиной тому разгром армии Карла Альберта, возвращение австрийцев в Милан и подписание мира, согласно которому Венеция вновь отходит к Австрии.