Вместо запрещенной газеты ФАКБ начала нелегально издавать внутренний «Информационный бюллетень», выходивший в Софии до середины лета 1948 г. В 1946 г. прошли подпольные пленарные заседания четырех региональных союзов — Юго-Западного (Дупница), Южно-болгарского (Ямбол), Северо-Западного (Плевен) и Северо-Восточного (Русе). Анархисты расширяли сферу своей работы. В этом же году в подполье реорганизовались анархо-синдикалисты, восстановившие в Софии Болгарскую конфедерацию труда с отдельным клубом, проводившим собрания и дискуссии; издавался печатный орган «Работническа солидарност». В конце года анархо-синдикалисты собрали общенациональную конференцию, которая приняла устав БКТ, или Национальной конфедерации труда в Болгарии (НКТБ) — болгарской секции МАТ. НКТБ выпустила три номера подпольной газеты «Класова борьба» (выходила до 1947 г.). Она резко критиковала официальные профсоюзы как инструмент государства и правящей партии [17].
Активное участие приняли анархисты в кооперативном движении. Некоторые из них играли при этом ключевую роль, выступая организаторами хозяйств по совместной обработке земли, работая в них агрономами и т. д. Такие объединения начали появляться еще накануне и в ходе второй мировой войны. С осени 1944 г. происходил новый подъем движения. Весной 1945 г. существовали 400 производственных кооперативов, объединявших 40 тыс. семей. При этом анархисты выступали против насильственной «коллективизации» по сталинскому образцу. По их мнению, «множество различных причин определяют относительно доброе расположение болгарских селян к общему хозяйствованию на земле. Следовательно, можно было расширять и умножать существовавшие инициативы, не прибегая к давлению» [18].
В августе 1946 г. в Софии собралась новая подпольная национальная конференция ФАКБ, которая должна была обсудить повестку дня намечавшегося в Париже международного анархистского конгресса. По своим масштабам и значимости эта конференция может быть приравнена к съезду Федерации. В ней участвовали около 50 делегатов от 40 окружных союзов, объединявших около 400 местных групп и организаций [19].
Анархистам в послевоенной Болгарии так и не удалось развернуть широкую книгоиздательскую деятельность. Они распространяли, в основном, книги прежних изданий. Все же им удалось переиздать несколько произведений теоретиков анархизма, включая «Хлеб и волю» П.А. Кропоткина, «Историю реки» Э. Реклю и «Беседы в кафе» Э. Малатесты [20].
Анархисты и анархо-синдикалисты, верные своим антигосударственническим принципам, выступили против реформ, проводимых в Болгарии режимом БРП. Они порицали проведение плебисцита за республику (сентябрь 1946 г.) как «излишнюю и бесплодную комедию», не имеющую ничего общего со «свободной трудовой республикой», которая может установиться только в ходе «народной революции». ФАКБ отвергла меры по организации движения соревнования и ударничества как «абсурдные и преступные». Она осудила государственную централизацию экономики, назвав государственное планирование «недомыслием» и голой «пропагандой». Национализацию экономики анархисты считали путем к «государственному социализму» на советский лад. По их представлению, средства производства должны были перейти не в собственность государства, а в распоряжение всего общества. В протестах анархистов подчеркивалось, что в Болгарии нет ни свободы, ни демократии. Они призвали к бойкоту парламентских выборов, а несогласных с этим — голосовать за оппозицию, поскольку народ стоит «перед чудовищным образом партийной диктатуры» [21].