В 1881 г., в память столетия основания города, по инициативе известного поэта Рафаэла Патканяна, было открыто ремесленное училище и в том же году — Гогоевское училище, (преобразованное затем в женскую гимназию имени Н. Гогоева), женское 5-классное училище имени Римсиме и др.
Царское правительство препятствовало созданию армянских светских школ, что усиливало влияние армянского духовенства, сохранявшего как бы монополию на народное «просвещение».
В 60-х гг. прошлого столетия полицейская власть отошла от магистрата. Приблизительно в то же время было введено хозяйственное управление городом, вследствие чего и эта функция отошла от армянского магистрата. С введением судебных уставов магистрат был лишен и судебных функций. Затем Городовое положение 1870 г., введенное в Нахичеване в 1871 г., придало городу общий муниципальный тип российских городов и армянский магистрат прекратил свое существование. В дальнейшем ряд «реформ», последовавших в царствование Александра II, коснулся и Нахичевана: армянское население города и селений в 1874 г. на общем основании было призвано к отбыванию воинской повинности.
Таким образом, все предоставленные когда-то армянам — выходцам из Крыма привилегии отошли в область истории.