В случае несогласия следователя с указаниями прокурора о привлечении в качестве обвиняемого, о квалификации преступления и объеме обвинения, о направлении дела для предания обвиняемого суду или о прекращении дела следователь вправе представить дело вышестоящему прокурору с письменным изложением своих возражений. В этом случае прокурор или отменяет указания нижестоящего прокурора, или поручает производство следствия по этому делу другому следователю (ст. 127 УПК РСФСР).
Следователь производит ряд следственных действий, связанных с уголовно-правовой квалификацией, т. е. с практическим применением норм уголовного права. Прежде всего это происходит при привлечении лица в качестве обвиняемого. В постановлении о привлечении в качестве обвиняемого кроме других обязательных реквизитов обязательно должно быть указано преступление в совершении которого обвиняется лицо, с уточнением времени, места и других обстоятельств совершения преступления, уголовный закон, предусматривающий данное преступление. Сущность предъявленного обвинения разъясняется обвиняемому при ознакомлении последнего с постановлением о привлечении в качестве обвиняемого. Если в ходе предварительного следствия возникнут основания для изменения предварительного обвинения или для его дополнения, следователь обязан предъявить обвиняемому новое обвинение.
Производство предварительного следствия заканчивается составлением обвинительного заключения либо постановления о направлении дела в суд для рассмотрении вопроса о применении принудительных мер медицинского характера, либо постановления о прекращении дела (ст. 199 УПК РСФСР).
Формулировка обвинения и его юридическая квалификация в обвинительном заключении излагаются путем указания, какое именно преступление вменяется обвиняемому, какой состав преступления предусматривает это действие (бездействие) и по какой статье или статьям Уголовного кодекса это деяние квалифицируется.
Конечно, применение следователем норм уголовного права в процессе предварительного расследования или отказ от применения этих норм не предрешают окончательного решения вопроса о судьбе лица, в отношении которого велось предварительное расследование. Ведь любое решение следователя, если оно незаконно, может быть отменено прокурором или судом в ходе рассмотрения уголовного дела. Однако несомненно, что решение следователя о применении или неприменении уголовно-правовой нормы, подкрепленное ссылками на имеющиеся по делу доказательства, оказывается серьезное психологическое воздействие на прокурора и судей, заставляя их принимать неверные решения и тем самым искажать советскую уголовно-правовую политику. Действия следователя, в основе которых лежат нарушения уголовно-правовых норм, отрицательно сказываются на формировании правосознания советских граждан (как при необоснованном применении уголовно-правовой нормы, так и при отказе от ее применения при отсутствии законных к тому оснований), что является немаловажным фактором, влияющим на реализацию уголовно-правовой политики.
Так, органы следствия предъявили обвинение М. Амбарцумян в злоупотреблении служебным положением (ст. 143 УК КазССР). М. Амбарцумян была признана виновной в том, что, работая бухгалтером республиканской конторы «Казкультторга», в декабре 1978 г., злоупотребляя служебным положением, при обнаружении у зав. складом радиомузыкальных товаров Кзыл-Ординской базы «Культторга» Шайбасова крупной недостачи товаро-материальных ценностей выдала ему две справки о необходимости переоценки радиоприемников на сумму 6341 руб. и магнитных лент на сумму 2573 руб. 60 коп. с последующим списанием этих сумм за счет фонда уценки товаров. Эта финансовая операция в последующем и была осуществлена.
Обвинительный приговор был утвержден прокурором, и затем по приговору Кзыл-Ординского областного суда М. Амбарцумян была осуждена по ст. 143 УК КазССР к одному году исправительных работ без лишения свободы с отбыванием наказания по месту работы и удержанием из заработка 20 % в доход государства. Все вышестоящие судебные инстанции Казахской ССР приговор оставили в силе.
При рассмотрении дела в Пленуме Верховного Суда СССР, куда дело поступило по протесту Генерального прокурора СССР, было установлено, что неверная квалификация действий М. Амбарцумян органами расследования, а затем и судебными органами основывалась на ошибочном заключении судебно-бухгалтерской экспертизы, не подтвержденном никакими другими доказательствами. На самом деле решение, принятое М. Амбарцумян в сложившейся ситуации, было законным. Пленум Верховного Суда СССР 1 декабря 1983 г. приговор суда и все последующие судебные постановления по этому делу отменил и направил его на новое рассмотрение. При новом рассмотрении уголовное дело в отношении М. Амбарцумян было прекращено за отсутствием в ее действиях состава преступления.[189]