3 36‐метровых десантных корабля (водоизмещение 122 тонны): П‐51 «Эцион Гевер», П‐53 «Кейсария» и П‐55 «Шекмона»; могли разбираться на две части для перевозки в Эйлат на грузовиках;
3 так называемых «60‐метровых десантных корабля» (водоизмещение 730 тонн): П‐61 «Ашдод», П‐63 «Ашкелон», П‐65 «Ахзив»;
— 8 десантных катеров LCM (НАМАХ) — 1 в Хайфе (ещё 2 были переброшены в Эйлат), 4 в Эйлате (включая прибывшие из Хайфы) и 3 на Кинерете;
— 10 торпедных катеров, в том числе 8 боеспособных (5 — на Средиземноморье, 3 в Эйлате) и 2 на ремонте:
среди катеров на Средиземноморье — 6 французских ТКА типа Меулан 62 тоннны. 3 катера в Эйлате — итальянские ТКА типа «Baglieto»;
— 8 мобилизованных рыболовецких судов.
В начале Шестидневной войны военное руководство Израиля поставило перед ВМС Израиля задачу — нанести удар по военно-морской базе Египта в Порт-Саиде.
Для осуществления операции были выделены эсминец «Яффа», несколько торпедных катеров и подразделение коммандос «Шайетет 13», которых предполагалось доставить с помощью так называемых «живых торпед» типа «Малайя».
В ночь на 5 июня 1967 г. отряд израильских судов в составе эсминца и нескольких торпедных катеров приблизился к Порт-Саиду, где был был встречен перед волнорезом двумя египетскими ракетными катерами типа «Оса» (пр. 205). Израильтяне открыли по ним огонь из 20‐мм пушек, и арабы поспешно повернули назад в гавань, не сделав ни одного выстрела. Оба катера египтян «Оса» были повреждены.
Затем израильские водолазы безуспешно пытались установить местонахождение трёх египетских торпедных катеров и трёх специальных судов по борьбе с подводными лодками, которые должны были находиться в порту Порт-Саида, кроме двух ракетных катеров «Оса». Водолазам удалось обнаружить только два нефтеналивных танкера, которые они не стали подрывать по невыясненным обстоятельствам.
В ночь с 5 июня на 6 июня 1967 г. израильская подводная лодка «Танин» с морскими диверсантами на борту проникла в тщательно охраняемую акваторию морской базы в Александрии.
Группа израильских водолазов (6 бойцов из «Шайетет 13») с зарядами для подрыва египетских военных судов, вышла через люк подводной лодки и пробралась вглубь порта.
По сведениям израильтян, еврейские морские диверсанты потопили 2 ракетных катера противника типа «Оса» и повредили 2 египетские подводные лодки прямо у причальных стенок. Египтяне же утверждают, что израильским боевым пловцам удалось подорвать только старую землечерпалку и баржу, а также повредить плавучий док.
Во время акции израильская подводная лодка была обнаружена гидроакустикой стоявшего у входа в гавань египетского эскадренного миноносца «Суэц», который непрерывно наносил удары глубинными бомбами.
6 июня подводная лодка обнаружила и атаковала вышедший в базовый дозор египетский фрегат «Эль Тарик». «Танин» произвела два двухторпедных залпа, но в обоих случаях вахта фрегата своевременно обнаруживала следы идущих торпед и египетский корабль маневрированием уклонялся от них. Затем «Эль Тарик» сам перешёл в контратаку, сбросив в место предполагаемого пуска торпед 8 глубинных бомб. В результате вышла из строя лодочная ГАС.
Тем не менее «Танину» удалось уйти, и 9 июня она вернулась на базу в Хайфу. Египтяне же утверждали, что потопили подлодку.
Подлодка «Танин» ждала водолазов почти до рассвета, прежде чем выйти в открытое море, но водолазы не возвратились. Не удалась и попытка экипажа «Танина» подобрать их по истечении суток, как было условлено на случай, если водолазы не уложатся в установленное время или перед ними возникнут непредвиденные трудности.
Дело в том, что в полдень 6 июня четверо израильских водолазов были замечены арабами в воде вблизи яхтенной гавани восточнее Александрии и взяты в плен. Ещё двое израильтян были схвачены 4 часа спустя, когда пытались овладеть моторной лодкой и бежать на ней.
На следующее утро 6 июня после нападения авиации на Порт-Саид, египтяне, в страхе перед израильскими ударами, поспешно увели свой флот из зоны военных действий. Атака израильских военных кораблей достигла важной цели: был предотвращен обстрел Тель-Авива с моря ракетами П‐15 с радиусом действия 35 миль. Этими ракетами были оснащены 18 советских ракетных катеров, переданных СССР Египту.
7 июня израильтянами был захвачен Шарм-эль-Шейх, планировалась помощь ВМС при захвате Эль-Ариша, но из-за быстрого продвижения сухопутных сил Израиля она не понадобилась. Также не был осуществлён рейд на Хургаду.
На 2 июня 6‐й флот имел в своем составе 2 авианосца, 2 крейсера, 16 эсминцев, 3 подводные лодки, 4 тральщика, вспомогательные суда и не менее восьми десантных судов с двумя тысячами морскими пехотинцами на борту.