Хотя Д. VI не проявлял особого интереса к женщинам, он был обязан позаботиться о продлении королевского рода. Политический выбор пал на четырнадцатилетнюю принцессу Анну (1574—1619), младшую дочь короля Дании Фредерика II. В августе 1589 корабль с принцессой направился в Шотландию, однако из-за шторма задержался в норвежских фьордах. Д. VI лично встретил и сопроводил невесту. Церемония бракосочетания состоялась в Осло 23 ноября 1589. После полугодичного пребывания в Эльсиноре и Осло пара возвратилась в Шотландию в мае 1590. На первых порах супружеские отношения складывались благополучно. В период между 1591 и 1607 в семье родилось восемь детей. В дальнешем Д. VI значительно охладел к супруге. Между 1593 и 1596 он серьезно увлекся Анной Муррей (Anne Murray), впоследствие леди Глеймис. Сохранилось стихотворение Д. VI, в котором он называет А. Муррей «
В 1607 Д. VI приблизил к себе Роберта Карра (Robert Carr, 1587—1645), первого графа Сомерсета. Семнадцатилетний юноша получил доступ в спальню короля и множество ценных подарков впридачу. В 1613 Р. Карр влюбился в жену лорда Эссекса Френсис Говард. Д. VI дал ей разрешение на развод, а Р. Карра наградил графским титулом. По всей вероятности, он рассчитывал на взаимопонимание, но просчитался. Д. горько упрекал Р. Карра, что сразу после свадьбы он начал «
В 1615 его жена Ф. Говард была обвинена в отравлении сэра Томаса Овербери, друга ее первого мужа Эссекса. Д. VI проявил личную заинтересованность в расследовании этого дела. После допроса с пристрастием Ф. Говард и Р. Карр признались в совершении преступления и были приговорены к смерти. В память о былой дружбе Д. VI помиловал бывшего фаворита и заменил смертную казнь семилетним заключением в Тауэр.
В 1614 новым фаворитом Д. VI стал Джордж Виллерс, первый герцог Букингемский (George Villers, 1st Duke of Buckingham, 1592—1628). Д. VI не скрывал своих чувств: «
Герцог Букингемский считался первым красавцем своего времени, сердцеедом и обольстителем женщин, в т. ч. М. Делорм. Его романтическое приключение с королевой Анной Австрийской составляет одну из сюжетных линий романа А. Дюма «Три мушкетера». Жена Д. VI Анна в письмах умоляла Д. Виллерса «
Мало кто из современников сомневался в характере их близости. Поэт Теофиль де Вио (1590—1626) в поэме «Au marquis du Boukinquan» назвал вещи своими именами:
Подстрочный перевод:
Сохранились письма, в которых Д. VI называл Д. Виллерса супругом, уверял, что желает «