В частности, по некоторым данным, Черкесов в 1979 году вел дело религиозного журнала «Община» и его редактора Владимира Пореша. В 1980 году он расследовал дело активистки ленинградского феминистского движения Натальи Мальцевой. В 1981 году занимался делами независимого профсоюза СМОТ, допрашивал свидетелей по делу Марка Морозова, позднее погибшего в тюрьме, а в 1982 году сам вел дело другого «СМОТовца» — Ростислава Евдокимова. В 1983 году Черкесов возглавил бригаду, расследовавшую дело Михаила Мейлаха, филолога, редактировавшего зарубежные издания Хармса и Введенского.
По данным газеты «Версия», Черкесов инициировал также и последнее в СССР дело по 70-й статье — дело Демократического союза (Е.Подольцевой, Ю.Рыбакова, В.Терехова и др.). Вокруг дела поднялся большой шум. В ответ Черкесов собрал пресс-конференцию, на которой объявил, что раскрыл антисоветский и шпионский заговор. В доказательство привел то, что во время обысков была изъята «машинка-факс», с помощью которой можно передавать тексты за границу[98]
. Кстати, по данным журнала «Профиль», непосредственно расследование дела лидеров Демсоюза вел Александр Федоров, который впоследствии стал первым заместителем Черкесова и курировал в его аппарате правовые вопросы[99].Почти сразу после назначения Черкесова на пост начальника Управления ФСБ по Санкт-Петербургу и Ленинградской области в 1992 году сессия Петросовета 117 голосами «за» (27 — «против», 15 — «воздержались») приняла обращение к Президенту России с просьбой отменить назначение «человека, участвовавшего в организации политических процессов против участников демократического движения 80-х годов».
В ответ на обращение Виктор Баранников, бывший министром безопасности РФ, в декабре 1992 года заявил, что назначение Черкесова было согласовано с Анатолием Собчаком
[100] — в смысле: разбирайтесь сами.По некоторым данным, в 1996 году именно Черкесов явился инициатором дела капитана Александра Никитина по обвинению в шпионаже. В 1999 году Никитин был оправдан по всем статьям обвинения и это дело признавалось экспертами, в том числе — и в самом ФСБ, как самое неудачное для российской госбезопасности[101]
.В 2000 году в ходе президентской кампании Черкесов активно работал в Центре стратегических разработок Германа Грефа, представляя там интересы Путина[102]
. Недруги позже говорили, что роль Черкесова в деятельности ЦСР была весьма незначительной.Тем не менее, по результатам работы Черкесов был направлен на другой фронт: вернулся на Северо-Запад, став Полномочным Представителем Президента РФ в новообразованном региональном Федеральном округе. По данным ряда источников, одной из главных задач Черкесова, назначенного в мае 2000 года полпредом, было смещение старого «недруга» Президента РФ губернатора Санкт-Петербурга Владимира Яковлева: якобы Черкесов должен был сделать все для того, чтобы Яковлев не смог выдвинуться на третий срок «губернаторства».
На протяжении двух лет длилось противостояние санкт-петербургской прессы и некоторых федеральных медиа-структур. В ходе этой «информационной войны» в злоупотреблении служебным положением, в коррупции и связях с криминальным миром поочередно обвинялись и Черкесов, и Яковлев[103]
.В период полпредства Черкесову ряд СМИ прочил различные государственные посты. Так, например, в 2001 году активно муссировались слухи о возможной замене им Генерального прокурора Владимира Устинова[104]
. Прогнозы о новом назначении Черкесова тогда не оправдались.В 2002 году в кулуарах Кремля, в Администрации Президента, в ФСБ, а также — в Государственной Думе ходили слухи, что, в случае замены руководителя Администрации Президента Александра Волошина на Николая Патрушева, следующим директором ФСБ может стать именно Черкесов.
В качестве аргументов, обосновывающих эти слухи, приводилось усиление и карьерный рост ряда соратников Черкесова. Так, Александр Кузнецов был назначен первым заместителем министра путей сообщения, а Владимир Вьюнов возглавил Северо-Западное таможенное управление вместо Владимира Шамахова — Кузнецов и Вьюнов долгое время занимали должности первых заместителей Черкесова.
Ряд источников к «ресурсам» Черкесова относил и финансиста «Газпрома» Виталия Савельева, впрочем, утратившего свое положение в газовой отрасли достаточно быстро.