Первой реакцией членов Исполкома СНБ на московское послание было удивление. По всем каналам официальных и неофициальных контактов проблема американских ракет в Турции была выведена за рамки обсуждения. Следуя этой линии, Исполком пришел к выводу: не увязывать проблемы безопасности Западного полушария и Европы друг с другом. Американская позиция заключалась в том, что решение всех других проблем возможно только после урегулирования Карибского кризиса.
Около 11 часов утра из Пентагона доложили неприятную весть. Самолет-разведчик U-2 «во время обычного полета по забору проб воздуха в результате навигационной ошибки» вторгся в воздушное пространство СССР. Ему на подмогу полетел американский истребитель, а в это время советские МиГи поднялись на перехват воздушного противника. К счастью, самолет-шпион смог вовремя покинуть советское воздушное пространство.
Первым об этом узнал министр обороны США Макнамара. По свидетельствам очевидцев, он стал абсолютно белым и в ужасе завопил: «Это означает войну с Советским Союзом!» Президент Дж. Кеннеди отреагировал намного спокойнее. Он улыбнулся и глубокомысленно промолвил: «Всегда найдется какой-нибудь сукин сын, до которого не доходят слова…»
Почти одновременно с этим пришла еще одна страшная новость. В полдень 27 октября в небе над Кубой был сбит американский разведывательный самолет U-2, пилот майор Р. Андерсон погиб. Самолет исчез с экранов радаров в районе Банеса в северо-восточной части острова. В дневной передаче радио Гаваны сообщало о катастрофе U-2.
После подтверждения гибели пилота в США пытались выяснить, был ли он сбит кубинцами или советскими силами. Первоначальные сообщения гласили, что самолет исчез вблизи пусковой площадки советского зенитно-ракетного комплекса SA-2 в Банесе. Американские эксперты сделали вывод: если только группа кубинцев не захватила контроль над установками в Банесе, то, следовательно, советские силы ПВО атаковали американский самолет, не ожидая ответа Кеннеди на предложение Хрущева. А это означало, что Советский Союз бросил вызов США. Необходимо было отвечать. В соответствии с действующими в ВВС США инструкциями, в случае потери самолета от зенитной ракеты, зенитно-ракетный комплекс противника должен быть атакован и уничтожен.
А что же было на самом деле?
Самолет U-2 вторгся в воздушное пространство Кубы и после окончания разведывательной миссии, идя на высоте 21 километр, уже начал выходить из него. Обстановка была напряженной: 27 октября советские войска и кубинская армия ожидали начала американской операции. Силы ПВО ВС Кубы и ГСВК были в полной боевой готовности. Заместителю командующего ГСВК по ПВО генерал-лейтенанту С. Н. Гречко доложили о нарушителе, однако времени на принятие решения было крайне мало. В это время И. А. Плиева на командном пункте не было, попытки связаться с ним оказались безуспешными. С. Н. Гречко заручился поддержкой заместителя командующего по боевой подготовке генерал-майора Л. С. Гарбуза и отдал приказ на уничтожение воздушного противника. Свое решение он мотивировал тем, что в условиях неминуемого авиационного удара противника разведывательная информация, собранная самолетом-шпионом, имела критически важное значение.
Первой же ракетой зенитно-ракетный комплекс С-75 «Десна» дивизиона под командованием майора И. Греченова, который нес боевое дежурство на позиции в районе города Банес, сбил нарушителя.
Генерал армии И. А. Плиев во время доклада о происшествии пришел в ярость: накануне он запретил открывать огонь без его личного разрешения. Кроме того, у Плиева уже была целая пачка указаний и директив из Москвы, в которых требовалось не поддаваться на провокации. Еще 25 октября он получил информацию о том, что два ракетных полка Р-14 вернулись домой, не дойдя до линии американской блокады. Более того, министр обороны требовал: «Вам надлежит головные части для Р-14 с транспорта „Александровск“ не разгружать. Если уже разгружены, то организуйте скрытно погрузку на „Александровск“. Транспорт „Александровск“ с головными частями Р-14 подготовить к отправке в Советский Союз в сопровождении „Альметьевска“. Пушки с расчетами снять. Тщательно проинструктируйте капитана корабля и начальника эшелона о их поведении в пути и действиях в соответствии с имеющейся у них инструкцией. В крайнем случае они обязаны корабль затопить».
27 октября в Гавану пришли новые инструкции: «Отправить „Александровск“ в сопровождении теплохода „Братск“ в Советский Союз»; «Прекратите всякие работы по установке Р-12 и Р-14 – этим раздражаете ООН. Тщательно маскируйте, работайте только по ночам».
Министр обороны Маршал Советского Союза Р. Я. Малиновский, узнав о сбитом американском самолете-шпионе, сдержал свой гнев. Его ответная шифротелеграмма, которую в Гаване получили утром в воскресенье, была короткой и на удивление «мягкой»: