Джим Уоррен Джонс родился в 1931 году в штате Индиана. Отец Джонса был инвалидом Первой мировой войны, который страдал от серьезных проблем с дыханием из-за травм, полученных во время атаки с применением химического оружия. Военной пенсии было недостаточно, чтобы прокормить семью, и мужчина время от времени подрабатывал, занимаясь ремонтом дорог.
Финансовые неурядицы порождали много разногласий между родителями Джонса. В 1934 году, в разгар Великой депрессии, их семью выселили из дома за неуплату ипотечных платежей. Родственники купили для них лачугу в соседнем городке Линн. В новом доме, где и вырос Джонс, не было водопровода и электричества. В Линне семья попыталась зарабатывать на жизнь сельским хозяйством, но снова потерпела неудачу, когда здоровье отца Джонса еще больше ухудшилось. Семье зачастую не хватало средств даже на еду, и Джонсы зависели от помощи своих родственников.
Своему воспитанию мальчик был обязан главным образом матери, которая скептически относилась к институту церкви, но верила в духов и сумела частично привить эту веру сыну. Не меньшую роль в воспитании Джонса сыграли его соседи – представители церкви пятидесятников.
Согласно многочисленным биографам Джонса, у его матери отсутствовал естественный материнский инстинкт: женщина часто пренебрегала своим сыном.
Когда Джонс пошел в школу, его родственнники пригрозили прекратить финансовую помощь, если его мать не устроится на работу. Отец мальчика несколько раз попадал в больницу из-за своей болезни. Джонс часто был предоставлен сам себе. Хотя его тети и дяди жили неподалеку и присматривали за ним, он часто бродил по улицам города, иногда голый. О Джонсе заботились жительницы Линна, приглашали его к себе, чтобы накормить и поделиться одеждой.
Джонс с детства проявлял интерес к религии. Миртл Кеннеди, жена пастора назарянской церкви, питала особую привязанность к мальчику. Она подарила ему Библию и поощряла его читать ее, обучала его следовать кодексу святости назарянской церкви. Когда Джонс стал старше, он начал посещать службы в большинстве церквей Линна каждую неделю и даже был крещен в нескольких из них.
Несмотря на сочувствие к трудному детству Джонса и бедственному положению его семьи, соседи сообщали, что он был необычным ребенком, одержимым религией и смертью.
Джонс регулярно посещал фабрику гробов в Линне и устраивал инсценированные похороны для сбитых на дороге животных. Однажды на одних из таких похорон мальчик убил кошку ножом.
Джонс утверждал, что обладает уникальными способностями, например, может летать. Однажды он спрыгнул с крыши здания, чтобы продемонстрировать это, но упал и сломал руку.
Другой страстью Джонса стало изучение социальных доктрин и различных политических систем. Он изучал биографии и взгляды Адольфа Гитлера, Иосифа Сталина, Карла Маркса и Махатмы Ганди. Впоследствии он говорил своей жене, что Мао Цзэдун был его героем. Джонс часами просиживал в общественной библиотеке и приносил книги домой, чтобы читать их по вечерам.
С началом Второй мировой войны у него возник сильный интерес к нацистской партии. Он был очарован ее помпезностью, сплоченностью и тотальной властью Гитлера. Окружающих приводило в замешательство то, что он превозносил нацистскую Германию. Джонс даже пытался подражать фашистсткому диктатору: приказывал другим детям ходить гуськом и избивал тех, кто не подчинялся.
Один друг детства вспоминал, как Джонс кричал «Хайль Гитлер!» и отдавал нацистское приветствие немецким военнопленным, которых провозили через их город по пути в следственный изолятор.
В старших классах Джонс продолжал выделяться среди своих сверстников. В юности Джонс имел прозвище Джимми и почти всегда носил с собой Библию. Его религиозные взгляды мешали ему заводить друзей, так как ребята его сторонились. Джонс часто отчитывал их за то, что они пьют пиво, курят и ходят на танцы. Временами он даже врывался на вечеринки и настаивал на том, чтобы они читали Библию вместе с ним.
Родители Джонса расстались в 1945 году. Джонс переехал со своей матерью в Ричмонд, штат Индиана, где в декабре 1948 года досрочно и с отличием окончил среднюю школу. Чтобы прокормить себя и мать, в 1946 году Джонс устроился санитаром в Ричмондскую больницу. Там же он познакомился с медсестрой-практиканткой Марселин Мэй Болдуин.
В 1954 году он начал проповедовать на улицах Индианаполиса за протестантов пятидесятников. Однако церковный совет почувствовал в нем угрозу из-за его слов о равенстве рас. Тогда Джонс решил основать собственную церковь, в которой не было бы различий между людьми по расовому или социальному признаку.