Как только они исчезли из вида, кто-то из посетителей кафе позвонил в полицию и вкратце рассказал о происшествии. По мнению посетителя, на его глазах произошло похищение человека, зверски избитого бейсбольной битой. Через некоторое время прибыли двое полицейских. Они опросили свидетелей происшествия и вернулись в свой офис. А на следующий день жена Джона Фавары, встревоженная отсутствием мужа, позвонила в полицию. Вслед за ее звонком один из детективов полиции прибыл в злополучное кафе и предъявил его хозяину Леону Папону фотографию Джона Фавары. «Да, он мой частый клиент, — подтвердил Леон Папон. — А тот клиент, который позвонил тогда в полицию, работает вместе с ним на мебельной фабрике. Он сказал мне, что того ударили по голове, а потом увезли в машине».
Агенты полиции приступили к расследованию исчезновения Джона Фавары. Они еще несколько раз допрашивали Леона Папона, показывали ему фотографии людей, которые, как им казалось, состоят в мафии Клана Гамбино. А спустя несколько недель в кафе Леона Папона появились двое молодых мужчин атлетического сложения. Поужинав и расплатившись с официантом, они попросили Леона Папона выйти с ними на лестницу. Он велел им убираться вон. Тогда один из них со всей силой ударил его в грудь, затем они выволокли хозяина из кафе. «Пока это лучший для тебя исход!» — крикнул ему один из бандитов.
На следующий день кафе Леона Папона было закрыто. А сам он наотрез отказался разговаривать с полицейскими, пытавшимися еще раз допросить его в связи с пропажей Джона Фавары. Через несколько дней семья Леона Папона покинула Нью-Йорк. Следствие зашло в тупик. Одни лишь подозрения Джона Готти в организации покушения на жизнь Джона Фавары, а конкретных доказательств не было. К тому же в день похищения Фавары Готти с женой отдыхали во Флориде.
Вот как доложил солдат Ваху: Джон Готти организовал убийство Джона Фавары и покинул Нью-Йорк для создания алиби.
После возвращения домой Джон Готти был вызван на допрос в полицию и в отделение ФБР. Он везде категорически отвергал обвинения в покушении на жизнь человека, признанного невиновным в гибели его сына. На том допросы кончились. Через некоторое время в полицию поступило анонимное сообщение о том, что разрубленное на мелкие куски тело Джона Фавары найдено на свалке машин.
Спустя шесть лет после исчезновения он был официально признан мертвым, и его жена получила официальное извещение о смерти супруга. Споры и предположения о причинах его смерти и о том, кто убийца, долго не утихали в американских газетах и исторических изданиях. Некоторые сходились во мнении, что убийца — Джон Готти. Высказывались доводы на основании его безжалостного характера. Главным же исполнителем приказа, по их мнению, был давний знакомый Джона Готти и соучастник Анжело Руджиерро, который привлек к совершению убийства двух своих соратников из отрядов мафии Пола Кастелано. Авторы этой теории ни на минуту не сомневались в своей правоте.
Однако авторы другой теория исчезновения Джона Фавары выдвигают иную версию, называя небезызвестного киллера Роя Де Мео главной фигурой покушения на жизнь несчастного Джона Фавары. Когда в печати появилось имя Роя Де Мео, оно тут же привлекло к себе внимание историков и журналистов. Им удалось выяснить немало подробностей из его жизни, в основном когда он оказался под влиянием Джона Готти.
Готти, помимо трех отрядов, владел группой профессиональных убийц, во главе которой и был Рой Де Мео. Кроме того, группа Роя Де Мео, несмотря на запрет Пола Кастелано, продолжала заниматься тайной торговлей наркотиками. У самого Де Мео были прямые связи с мексиканскими наркодилерами.
В ноябре 1982 года агенты ФБР, вероятно, случайно напали на след поставщика наркотиков, который имел прямые связи с Роем Де Мео. Он был арестован, и у него обнаружили 23 тонны марихуаны, 25 килограммов кокаина и полмиллиона искусственного наркотика «квуалюд».
Вероятно, Рой Де Мео заподозрил слежку агентов ФБР. Он на время оборвал все связи с наркомафией, в том числе и с мексиканскими контрабандистами. Но в начале 1983 года эта история стала известна главе мафии Полу Кастелано. Тот вызвал к себе Джона Готти и высказал ему подозрения об участии его подчиненного в наркобизнесе. Готти со свойственной ему резкостью и категоричностью все отрицал, и Аниэлло Деллароси тоже.
Тогда Кастелано вызвал на «чертову кухню» Роя Де Мео. Но тот не пришел на свидание с главой мафии в назначенное им время. И тогда Пол Кастелано принял решение.
На следующий же день, 10 января 1983 года, труп Роя Де Мео был найден в багажнике его собственной машины. Нино Гаги в тот же день позвонил своему боссу.