В некоторых исторических изданиях высказывалось предположение о том, что Готти даже планировал покушение на Анжело Руджиерро, не дожидаясь его естественной смерти, но состояние здоровья близкого друга не внушало оптимизма. Анжело Руджиерро умер 5 декабря 1989 года в возрасте сорока девяти лет.
Джон Готти не пришел на его похороны, сказав своему второму «заму» Фрэнку Локазио, не понимавшему, почему босс не посетил умирающего Руджиерро: «Единственное, что я бы мог сделать, заглянув в его глаза до смерти, — помочь ему поскорее отправиться на кладбище».
Тем не менее охота на Готти и членов его мафии постепенно набирала обороты. Очередной арест произошел 27 октября 1987 года — в день рождения Джона Готти, которому исполнилось сорок семь лет. Оба арестанта были намного старше «босса боссов»: Джозефу Армоне исполнилось семьдесят два года, Джо Галло — семьдесят четыре. Дело против них вскоре было передано в суд. Нью-йоркская прокуратура обвинила их в рэкете.
Во время разбирательства Джозефу Армоне было сделано заманчивое предложение: рассказать правду о преступной деятельности мафии времен Пола Кастелано и Джона Готти — первое условие; подробно о рэкете — второе условие; и подтверждение участия Джо Галло в других сферах их совместной преступной деятельности — третье условие. В этом случае он освобождался от судебного преследования и тюремного заключения. Но Джозеф Армоне, верный присяге «Омерта», держал язык за зубами и отказался от сделанного ему предложения.
Джозеф Армоне и Джо Галло были признаны виновными в предъявленных обвинениях, каждого из них приговорили к десяти годам тюремного заключения. «Скорее всего, там и закончится их жизнь», — прокомментировал судебный приговор глава Клана Гамбино, сам со дня на день ожидавший ареста.
Но, несмотря на столь мрачные мысли, Джон Готти продолжал активно развивать преступную сеть своей мафии. Рэкет занимал главенствующую позицию в перечне наиболее доходных источников мафиози. Содержание тайных карточных клубов с проститутками было второй статьей. Затем шли банковские аферы и автоугоны с последующей продажей машин в страны Африки и Азии. Наркобизнес при этом никогда не пропадал из поля зрения Джона Готти. Формально он сохранял в своей мафии закон времен Пола Кастелано, запрещавший торговлю наркотиками, но тайно расширял сеть этого бизнеса, самого, по его мнению, доходного.
Его мафия процветала больше, нежели во времена ее основателя, легендарного Карло Гамбино. Об этом говорится в книге «Первый зам» (
По всей вероятности, эти данные находились в распоряжении нью-йоркского отделения ФБР, доподлинно изучившего последние годы жизни Джона Готти. В те дни ФБР совместно со следователями Манхэттенского округа нью-йоркской прокуратуры заканчивало расследование покушения на жизнь главы крупнейшего в Нью-Йорке профсоюза строительных рабочих Джона О’Коннера.
Обе следственные организации на протяжении нескольких месяцев собирали доказательства покушения, вызвавшего негодование сотен тысяч строительных рабочих. Организатором этого преступления, как считали следователи, был Джон Готти. Они полагали, что он безуспешно пытался обложить богатейший профсоюз «данью», что и стало мотивом убийства.
В конце 1988 года уголовное дело против Джона Готти было готово для передачи в федеральный суд Манхэттена. Неожиданно дело застопорилось. Кроме Джона Готти в числе обвиняемых числился Анжело Руджиерро, на тот момент смертельно больной, который не мог присутствовать в суде, и его исключили из списка обвиняемых.
В соответствии с данными перехваченных разговоров между Джоном Готти и Анжело Руджиерро картина убийства профсоюзного лидера была именно такой, как отражена в обвинительном акте. К его убийству были привлечены четверо киллеров из мафии Джимми Конана, мало кому известной в Нью-Йорке. Его банда никогда ранее не имела контактов с «итальяно-американскими мафиями», но Готти был наслышан о профессионализме этих убийц. В обвинительном акте утверждалось, что именно эта банда 7 мая 1986 года убила профсоюзного босса.
Через несколько дней после возбуждения дела об убийстве Джона О’Коннора Джон Готти был арестован. О его аресте сразу же стало известно репортерам нью-йоркских газет. Им удалось взять у мафиози интервью. «Против меня десятки прокуроров. Пятьдесят против одного. Но все равно победителем буду я», — сказал им Джон Готти.