В итоге под запись было сформулировано, что агентурно-войсковая система специальных розыскных мероприятий, проводимых органами контрразведки «Смерш» совместно с командованием, включает в себя: организацию наблюдения за вероятными местами проникновения через передний край фронта и маршрутами движения шпионов, диверсантов и террористов к местам дислокации воинских частей и соединений Красной Армии, а также за возможными местами их появления и укрытия, конспиративный осмотр таких мест; проверку документов у подозрительных лиц, появляющихся в полосе боевых действий; поиск агентов противника на местности, в населенных пунктах и других местах с помощью содержателей агентурных квартир – ловушек, агентов-опознавателей, войсковой охраны и патрульной службы, других военнослужащих, имеющих возможность постоянно передвигаться по своему служебному долгу в участках фронта; контроль за эфиром с помощью радио – контрразведывательной службы в диапазоне волн, используемых противником для связи со своими агентами; наблюдение за их родственниками и близкими связями (проводится соответствующими органами по конкретному запросу о получении данных на них). При выявлении на объекте оперативного обслуживания земляков (односельчан) разыскиваемых и других близких связей заводить дубликаты розыскных дел для осуществления активных мероприятии розыска их по отдельному плану.
В качестве агентов-опознавателей могут быть использованы: с санкции ОКР «Смерш» армии – некоторые явившиеся с повинной вражеские агенты; с санкции УВКР «Смерш» фронта – находящийся под следствием по уголовному делу агент противника, если тлеются возможности задержания с его помощью значительного количества соучастников (как, например, это имело место с преподавателем Бреславской разведшколы Пащенко). При этом нельзя допускать, чтобы в этих целях предлагалось использование разоблаченных вражеских агентов и преподавателей разведшкол, для опознания своей агентуры, если выявлены их тяжкие преступления против нашей Родины, особенно тех из них, у которых руки по локоть были в крови наших людей.
Наряду с выявлением и розыском вражеских агентов органы контрразведки «Смерш» обязаны были вести борьбу с изменой Родине и дезертирством из частей действующей армии и флота. Эти преступления совершали отдельные антисоветские элементы, оказавшиеся на фронте, лица из числа осужденных за различные преступления и направленные в действующую армию для искупления своей вины, а также неустойчивые люди, попавшие под влияние немецко-фашистской пропаганды и не верившие в победу Советского Союза над гитлеровской Германией.
В соответствии с Постановлением Государственного Комитета Обороны от 11 октября 1942 года № 2401 дезертиров, занимавшихся бандитизмом или вооруженными грабежами, предавали суду военного трибунала по ст. 58–16 УК РСФСР (измена Родине, совершенная военнослужащим). Этим же постановлением при исключительных обстоятельствах в целях восстановления порядка в воинской части и оздоровления боевой обстановки к особо опасным дезертирам предусматривалось применение военным трибуналом высшей меры наказания – расстрел перед строем части.
Работа особых отделов, а затем и «Смерш» по выявлению изменнических намерений и попыток отдельных военнослужащих дезертировать должна была начинаться, как правило, в запасных частях. Там через негласных сотрудников выявлялись военнослужащие с изменническими и дезертирскими намерениями, а также учитывались признаки, свидетельствующие о подготовке этих видов преступлении: повышенный интерес к вражеским листовкам, служившим «пропуском» для перебежчиков; сбор и хранение таких листовок; заучивание на немецком языке отдельных фраз и слов, необходимых для объяснения своего перехода линии фронта; стремление собрать секретные сведения в целях их передачи противнику после перехода; выяснение отношения противника к перебежчикам и военнопленным и т. д.
Негласные сотрудники при выявлении у военнослужащих признаков, подозрительных на изменнические и дезертирские намерения, обязаны были немедленно о них сообщить оперработнику, в крайнем случае, командиру или самостоятельно принять меры и любы ми средствами пресечь преступление.
В зависимости от обстоятельств оперработник должен провести расследование по поступившему сигналу и решить вопрос об аресте подозреваемого, в связи с чем конвоировать его в распоряжение следователя ОКР «Смерш» дивизии. Если данных для такого решения недостаточно, а вести надежно обеспеченную разработку по месту службы, особенно на переднем крае, нет необходимых возможностей и опасно, его через командование следовало перевести под благовидным предлогом в подразделение, где обеспечивалось продолжение активной разработки, выявление свидетельской базы и завершение расследования.