С мая 2006 года – член Правительственной комиссии по делам несовершеннолетних и защите их прав.
С июня 2006 года – заместитель председателя Правительственной комиссии по противодействию злоупотреблению наркотическими средствами и их незаконному обороту.
9 октября 2007 г. Путин подверг жесткой критике Министерство образования и науки за недочеты при формировании госзаказа на подготовку специалистов для регионов. «Зачем такой заказ, который не соответствует потребностям региона? – спросил Путин у Фурсенко на заседании Совета законодателей. – Я не понимаю, как вы готовите заказ, если у вас есть подозрения, что за многими регионами стоит лоббизм отдельных вузов, которые не хотят перестраиваться и которым легче работать по старым лекалам, а такая опасность существует, но вы из Москвы не всегда гибко реагируете». (РИА Новости, 9 октября 2007)
После отставки правительства Фрадкова в сентябре 2007, сохранил свой пост в обновленном составе правительства во главе с Виктором Зубковым.
9 октября 2007 г. Путин подверг жесткой критике Министерство образования и науки за недочеты при формировании госзаказа на подготовку специалистов для регионов. «Зачем такой заказ, который не соответствует потребностям региона? – спросил Путин у Фурсенко на заседании Совета законодателей. – Я не понимаю, как вы готовите заказ, если у вас есть подозрения, что за многими регионами стоит лоббизм отдельных вузов, которые не хотят перестраиваться и которым легче работать по старым лекалам, а такая опасность существует, но вы из Москвы не всегда гибко реагируете». (РИА Новости, 9 октября 2007).
12 мая 2008 года новый глава правительства В.Путин произвел назначения в правительство. Фурсенко сохранил пост министра образования и науки.
С мая 2009 – член Комиссии по модернизации и технологическому развитию экономики России (председатель – президент Медведев).
Член совета при президенте РФ по реализации национальных проектов, глава межведомственной рабочей группы по национальному проекту «Образование».
Член Совета директоров ОАО «Российская электроника».
Автор более 100 научных работ.
В 1991–1993 гг. в соавторстве с доцентом кафедры физической механики СпбГУ Татьяной Хантулевой написал теоретическую работу «Нанесение равномерных тонких покрытий в химических реакторах» (по версии Т.Хантулевой: «Точнее, это я писала. А он мою работу контролировал» – «Версия», № 14,12–18 апреля 2004).
Является бенефициаром-совладельцем консалтинговой компании в Кельне.
Женат вторым браком; супруга – Смирнова Надежда Александровна. Первая жена Татьяна Фурсенко, сын Александр 1979 г.р.; окончил ФТИ, работал в одной из коммерческих структур Санкт-Петербурга; бывшая жена и сын живут в США (со слов бывшей соседки: «…Танин брат победил на какой-то олимпиаде в Америке и вызвал Таню туда к себе. Она уехала с сыном и матерью, а Андрей остался» – «Версия», № 14, 2004).
Младший брат Сергей Фурсенко – по образованию энергетик, был гендиректором ООО «Лентрансгаз»; с 2008 года – президент холдинга «Национальная медиагруппа».
ФУРСЕНКО Сергей Александрович – президент холдинга «Национальная Медиа-группа» (НМГ) (2008), бывший генеральный директор ООО «Лентрансгаз» (2003–2008), президент футбольного клуба «Зенит», президент Российского футбольного союза (РФС) (февраль 2010), соучредитель дачного кооператива «Озеро» (1996).
Родился 11 марта 1954 в Ленинграде, сын советского академика, историка-американиста Александра Александровича Фурсенко и его жены Натальи; младший брат министра образования и науки (с 2004 г.) Андрея Фурсенко.
В 1973 году окончил Ленинградскую физико-математическую школу № 239.
В 1978 году окончил Ленинградский политехнический институт (ЛПИ) им. М.И. Калинина по специальности «электрические аппараты».
После окончания института остался на кафедре ЛПИ в должности младшего научного сотрудника (1978–1979).
С 1979 по 1988 гг. работал во Всесоюзном НИИ Радиоаппаратуры старшим инженером, а затем начальником научно-исследовательской лаборатории, был ответственным исполнителем разработки автоматизированного комплекса технического управления и контроля системы посадки космических кораблей многоразового использования
В 1988 г. участвовал в обеспечении автоматической посадки космического корабля «Буран».
В 1987 г. был командирован на Кубу для работы по внедрению системы управления воздушным движением Республики Куба.
С 1989 по 1991 гг. исполнительный директор советско-болгарского совместного предприятия СП «Техноэксан», специализирующегося на экспорте высоких технологий и наукоемкого оборудования (учредители – Физико-технический институт им. академика Иоффе и Институт прикладной физики в Пловдиве).
В 1990 году стал генеральным директором ТОО «Научно-производственное предприятие (НПП) «ТЭМП».