Работа в рамках проекта «Синяя книга» началась в марте 1952 года, а завершилась в январе 1970-го. По факту это был самый продолжительный проект систематического изучения НЛО в истории, если, конечно, не учитывать самодеятельность организаций уфологов типа отечественного «Космопоиска», основанного в 1980 году и действующего по сей день. «Синюю книгу» запустили по инициативе генерала авиации Чарльза Кэбелла, возглавлявшего разведку ВВС, а название проекта связывают с цветом обложек буклетов, которые используются при тестировании в американских колледжах и университетах.
Первым руководителем проекта стал капитан авиации Эдвард Руппельт, под его началом работали десять офицеров. В конце 1953 года он покинул группу и ушел из ВВС. В 1956 году Руппельт опубликовал книгу «Рапорт о неопознанных летающих объектах» (Report On Unidentified Flying Objects), в которой рассказал общественности о секретных исследованиях по проблеме. На посту руководителя проекта его сменил капитан Чарльз Хардин, в 1956 году директором стал капитан Джордж Грегори, в 1958 году — майор Роберт Фрэнд, в 1963 году — майор Гектор Кинтанилья. Главным научным консультантом был астроном Джозеф Аллен Хайнек, имевший непосредственное отношение к практической космонавтике: он, например, подтвердил запуск первого советского искусственного спутника и вычислил параметры его орбиты.
Вышестоящие товарищи поставили перед сотрудниками проекта «Синяя книга» две главные задачи. Первая — определить, представляет ли феномен НЛО угрозу для национальной безопасности США. Вторая — проанализировать наблюдения НЛО с научной точки зрения и по возможности установить их природу. За время своей работы сотрудники проекта собрали 12 618 сообщений о НЛО; причем необъясненными остались лишь 5 % от общего числа наблюдений.
Надо сказать, что цифры процентного соотношения объясненных/необъясненных наблюдений со временем менялись. При капитане Руппельте (т. е. до конца 1953 года) без объяснения оставалось 20 % наблюдений; при капитане Хардине (до конца 1956 года) значение снизилось до 0,4 %, а при Кинтанилье это соотношение вообще стало нулевым. Снижению уровня «неопознанности» способствовало более тщательное изучение свидетельств и, конечно, предубеждение наследников Руппельта, которые в отличие от него не считали НЛО чем-то сверхъестественным, а старались подобрать наиболее простое объяснение — вполне в духе «бритвы Оккама» и презумпции естественности. Интересно, что астроном Хайнек был привлечен в проект именно как скептик, называвший проблему НЛО «смехотворной», но работа с очевидцами и давление со стороны директоров проекта заставили его пересмотреть точку зрения: после закрытия «Синей книги» он организовал самодеятельный Центр изучения НЛО (Center for UFO Studies, CUFOS), который и сегодня занимается сбором информации о феномене. Получается, что анализ результатов исследования в данном случае сильно зависит от личных взглядов самих исследователей. Можно ли в таком случае называть уфологию наукой?
Росту скептицизма директоров проекта «Синяя книга» способствовали и начавшиеся испытания высотного самолета-разведчика У-2 (Lockheed U-2), о которых им было известно. Конструирование У-2 началось в 1953 году; он должен был совершать облеты территории СССР на высоте 21 км, что делало его, по мнению американцев, неуязвимым для советской противовоздушной обороны. Проектируя его, инженеры рассчитывали, что некоторое время разведывательные рейды над СССР останутся незамеченными. Их предположение в целом подтвердили испытания, проведенные в 1955 году над территорией США. Они показали, что самолет очень трудно обнаружить при помощи радаров. В течение каждого вылета американским радиолокационным станциям удавалось зафиксировать У-2 лишь один или два раза. Впрочем, скоро выяснилось, что новейший самолет-разведчик можно увидеть невооруженным глазом, даже когда он летит на максимальной высоте. Большинство сообщений о наблюдении НЛО поступало от пилотов авиалайнеров: они замечали У-2 обычно после захода солнца при рейсе с востока на запад. Реактивные авиалайнеры середины 1950-х годов летали не выше 6000 м. В сумерках они оказывались в зоне темноты, тогда как У-2, находящийся на высоте 20–21 км, все еще освещался солнцем. Его длинные крылья отражали солнечные лучи; он появлялся как быстро движущийся сверкающий объект и исчезал из поля зрения — феерическое и запоминающееся зрелище! Многие пилоты гражданской авиации служили раньше военными летчиками и точно знали, что не бывает самолетов, летающих выше 14 км и с подобной скоростью. Соответственно, он мог быть только «летающей тарелкой»! Причем при хороших погодных условиях У-2 можно было заметить даже с земли — как движущуюся сверкающую точку высоко-высоко в небе. Архив «Синей книги» пополнился множеством новых взволнованных писем.