В последнем десятилетии XI в. возникло неоисмаилитское движение, в результате которого появился орден ассасинов. Его основателем стал перс, Хасан ас-Саббах (ум. 1124). Хасан начал свою удивительную карьеру с захвата Аламута, мощной крепости в горах Эльбурс, расположенной на высоте трех тысяч метров над уровнем Каспийского моря. Из этого «орлиного гнезда» Хасан начал кампанию по распространению своего так называемого «нового учения». Надо сказать, что оно привлекло к себе множество недовольных своим экономическим и религиозным положением мусульман, объединив их в тайную организацию, чьей целью были поиски лучшей доли. Возглавляемый Великим магистром, этот орден имел жесткую иерархическую структуру, в самом низу которой находились те, кто был готов к «самопожертвованию». Эти последние были способны на все, на любой риск и превратили убийства неугодных в искусство. Ассасины наводили ужас на весь мусульманский мир. Если верить красочному, хотя и сделанному значительно позже рассказу Марко Поло, Великий магистр раздавал юным послушникам гашиш (отсюда произошло само название ордена — «хашишины»), позволял им предаваться в своем саду наслаждениям с прекрасными девами, после чего отдавал им приказ убрать того или иного врага. Наградой убийце служили те же самые удовольствия, только уже в раю. По сей день в сирийских горах сохранились крепости ассасинов, некогда наводившие ужас на крестоносцев. Впрочем, пощады не было никому, в том числе и братьям-мусульманам. Одной из первых жертв ассасинов стал в 1092 г. знаменитый визирь в Багдаде, перс по национальности Низам аль-Мульк. А вот попытка убрать Салах ад-Дина оказалась безуспешной.
Тем временем ислам породил и более мирные ордена, которые привлекли в свои ряды большое число сторонников. Многие из них существуют и по сей день. Представлявший собой особую форму мистицизма суфизм появился как реакция против чистого интеллектуализма и косного традиционализма в религии. Особое внимание суфии уделяли эмоциям (любви), «внутреннему свету» (интуиции) и аскетизму как способу познания Аллаха, позволяющего установить с ним личный контакт и добиться с ним единения. Это учение нашло последователей как среди шиитов, так и среди склонных к конформизму суннитов. По мере своего развития суфизм вбирал в себя элементы христианских практик, гностических учений и даже буддистских идей, таких как, например, единение с Божеством до растворения в нем. Свое название это течение получило от арабского слова «суф» (шерсть). Таким образом, излюбленное одеяние суфиев делало их облик схожим с внешностью христианских монахов. Практика уединенных медитаций и долгих бдений также напоминает уклад христианской монастырской жизни. В XII в. суфии начали объединяться в братства, жившие в собственных монастырях (takiyah, zawiyah), возглавляемых шейхами. Желающие вступить в орден проходили наставление и инициацию, которыми руководил шейх. Орден мог иметь несколько школ, все они подчинялись главному шейху. Каждый орден разрабатывал собственную систему ритуалов, включая песнопения и музыку, ранее не присущие традиционному исламу.
Самый ранний братский орден был основан в Багдаде Абд аль-Кадиром аль-Джилани (ум. 1166). Известный под названием кадириты, на сегодняшний день это самый большой орден, насчитывающий множество приверженцев от Алжира до Явы. Орден ар-Рифаи, названный в честь Ахмада ар-Рифаи (ум. 1175), известен благодаря таким странным подвигам своих членов, как, например, глотание тлеющих углей или бескровное протыкание тела кинжалами. Еще один популярный орден — мавлави, или танцующие дервиши, — был основан персом Джалал ад-Дином ар-Руми, жившим в Анатолии вплоть до самой своей смерти в 1173 г. Этот орден известен благодаря музыке и песням, написанным его основателем, которые считаются очень изысканными и нежными. К числу приверженцев более позднего ордена сануси, действовавшего в Ливии, относились и члены королевской семьи. Свое название он получил в честь алжирского шейха, основавшего его в 1837 г., и наряду с религиозными его члены преследуют также военные и политические цели. Развязанная им в Ливии война против итальянцев внесла значительный вклад в дело освобождения страны.