Герцог д'Антен умер 9 декабря 1743 года, и уже 11 декабря Великим Мастером избрали принца Луи де Бурбона, графа Клермонского. В тот же день опубликовали французский кодекс масонских законов. Теперь Великая Ложа стала называться Великая английская Ложа во Франции.
Принц Луи оставался во главе сообщества вплоть до своей смерти в 1771 году. Период правления связан с расширением и развитием так называемых высших степеней, среди них: шотландский Мастер, глава Клермона (1754), рыцари Востока (1756) и императоры Востока и Запада (1758). Введение последних двух степеней привело к сильным разногласиям с Великой Ложей, которая с 1755 года стала именоваться Великой Ложей Франции.
«Императоры» образовали вторую независимую ложу, возник раскол и среди «Рыцарей Востока» (в основном объединявших крупных торговцев), в результате на Высочайшем совете в 1762 году произошел раскол. По распоряжению Великого Мастера деятельность «Рыцарей Востока» была приостановлена вплоть до 1771 года. Только в Париже в то время было около восьмидесяти лож. Были ложи и в департаментах, так, например, три действовали в Руане, несколько в Бордо.
Следующий период начинается с формального правления герцога Шартрского, впоследствии герцога Орлеанского, «гражданина равенства», и заканчивается полным изгнанием франкмасонства в бурные дни революции. Герцог Люксембургский был избран помощником Генерального прокурора. Затем предпринимались попытки объединить так называемые высшие степени с Великой Ложей. В марте 1773 года учредили Великую Национальную Ложу Франции.
После этого герцога Шартрского назначили Великим Мастером, и 27 декабря 1773 года Великая Национальная Ложа стала Великой Ложей Восточной Франции. Тогда же назначили комиссию (так и не приступившую к своим обязанностям), чтобы она разобралась с высшими степенями, а пока предписали, чтобы все ложи функционировали только в соответствии с тремя степенями.
Тем не менее эти высшие степени продолжали процветать, в частности шотландские философские ритуалы (школа герметиков в Авиньоне), Elus Coens, социальный договор, Академия истинных масонов, Филалет и филадельфийцы, розенкрейцеры в Аррасе и, наконец, египетские ритуалы Калиостро. Чтобы проконтролировать эти и некоторые другие системы (или ритуалы), ложа Великий Восток решила создать Палату степеней (1782).
По инициативе А. Ретье де Монтало, выдающегося масона своего времени, в 1784 году была образована Beликая главная Ложа Франции, которая после соединения в 1787 году с главной ложей метрополии утвердилась в праве присваивать высшие степени.
Ложа Великий Восток свела эти степени к четырем, поддержав тем самым утверждение современного ритуала, в соответствии с которым сегодня функционируют большинство французских лож. Следует заметить, что Главная ложа метрополии полагала, что желательным является существование восьмидесяти одной степени. Примерно в конце этого периода после расследования возобновила свою деятельность ложа розенкрейцеров в Руане, на новом этапе продолжив самостоятельное существование рядом с ложей Великий Восток.
Беспокойные времена революции положили конец масонской деятельности. Огромное количество лож закрыли двери. Великий Мастер, теперь «равноправный гражданин», публично отрекся от франкмасонства и был казнен на гильотине в ноябре 1793 года. На следующий год едва ли можно было встретить следы масонства где-либо во Франции.
В 1795 году, когда наступило более спокойное время, А. Ретье де Монтало (читателю уже довелось слышать это имя) из остатков старых лож образовал не как Великий Мастер, а как Великий преподобный (венерабль) новую ложу Великий Восток. В 1798 году ее учреждение поддержали полицейские власти. На следующий год Великая Ложа, то есть управляющий орган Французского приората, предшествующая Великому Востоку 1773 года, после стихийного выступления в 1796 году была фактически поглощена своим поздним соперником. Осталась только одна ложа, Великий Восток (или Великая Ложа), которая была провозглашена и утверждена.
Однако рядом с Великим Востоком быстро утвердились еще две масонские структуры. 22 сентября 1804 года граф де Грасс Тили учредил в Париже Высший совет 33-х, провозгласивший себя преемником древних и принятых шотландских ритуалов. Он на самом деле по прямой линии происходил от «Императоров» 1758 года, возможно, и от «Главы Клермона» 1754 года. Однако высшая власть новой масонской надстройки была учреждена в Чарльстоне, Северная Каролина, в 1801 году.
Великая шотландская ложа была образована 22 октября Высшим советом 33-х, избрав Великим Мастером принца Луи Бонапарта. Однако когда принц Жозеф Бонапарт, впоследствии король Неаполя, был выдвинут в качестве главы Великого Востока, три управляющие структуры превратились в одну вследствие договора от 3 декабря того же года. Инициаторами объединения были маршалы Массена и Келлерман. Однако в 1805 году договор аннулировали, и в то время как Великая шотландская ложа испускала последнее дыхание, Великий Восток и Высший совет Франции продолжали существовать параллельно.