Весь Могилевский повет был преобразован в полк — административно-территориальную единицу. Он разделялся на сотни, которыми руководили сотники, обеспечивавшие формирование, питание и снабжение своих подразделений. Сотниками стали шляхтичи, близкие к Поклонскому. Могилевскому полку был передан еще и Кричевский повет. На этой территории Поклонский пытался создать по украинскому образцу автономную единицу, но в составе Московского государства, а не Запорожского войска, которой бы управляла шляхта. Оккупационные власти благосклонно отнеслись к замыслу Поклонского. Они противопоставляли его «казаков» и административно-территориальную структуру запорожской казацкой старшине во главе с И. Золотаренко.
Однако от такого соперничества сильно страдали крестьяне, у которых казаки Золотаренко отбирали хлеб, лошадей и скотину. В свою очередь крестьяне грабили шляхетские поместья. Поскольку Поклонский не мог заставить крестьян подчиняться своим владельцам и вернуть награбленное имущество, то и шляхта стала отворачиваться от него. К тому же царь не удовлетворил его просьбы о земельных пожалованиях для своих сторонников и лично для себя.
После захвата Смоленска, Дубровны, Полоцка и Витебска основные цели кампании 1654 года московское правительство достигло. За 7 месяцев войны московиты захватили все земли ВКЛ восточнее Западной Двины и Днепра, включая 33 города и местечка — от Невеля на севере до Гомеля на юге. Поэтому часть войск была отпущена до весны по домам.
Советская историография всегда изображала войну Москвы против Речи Посполитой как войну с целью освобождения беларусов от «польско-литовского завоевания». Но документы неопровержимо свидетельствуют, что под названиями «литовские люди», «польско-литовские гарнизоны» и «польско-литовские войска» выступало коренное местное население. Многочисленные «росписи литовских полоняников» содержат только беларуские фамилии и имена. Никаких этнических литовцев (жамойтов) среди них не было, а поляки встречались в единичных случаях.
Царские власти уверяли местную шляхту в том, что желают ей спокойствия и богатства, гарантируют сохранность поместий и добьются того, «чтоб мужики из них не бегали и не разорили». Увидев, что московское правительство берет под свою защиту ту часть шляхты, которая присягнула царю, крестьяне стали избавляться от царистских иллюзий.
Оккупанты громили униатские церкви и монастыри, закрывали католические костёлы и учебные заведения, их земельные владения конфисковывали, передавали православным монастырям и церквам или отписывали в личную собственность царя. Православная церковь, несмотря на свою промосковскую ориентацию, новых земель получила очень мало, а местному духовенству новые власти не доверяли. Документы свидетельствуют, что сюда из Московии присылали священников на определенный срок («по череде»).
На захваченных Москвой землях создалась исключительно сложная ситуация. Крестьяне сильно страдали от военных действий: вытаптывались посевы, горели жилые и хозяйственные постройки. Московские бояре и дворяне захватывали крестьян и отправляли их как рабов в свои поместья. В царскую канцелярию шел поток жалоб от крестьян и шляхты, присягнувших царю, с требованием прекратить грабеж московских «ратных людей», вернуть крестьян домой. Так, в сентябре 1654 года с жалобой к царю обратились крестьяне деревень Любовицкого стана Оршанского повета:
«Как мы, сироты твои, прослышали твое государево пришествие, и мы, сироты твои, тебе, государю, с хлебом и солью били челом. А ныне у нас, сирот твоих, женишка и детишка, все без вести распропали, потому что побрали твои государевы люди и развезли по разным полкам, и к тебе государю под Смоленск, а животишка, статки все у нас и скотину и хлеб поймали, и домишка пожгли, скитаемся по лесам нагие и босые, сидим на попелище, с холоду и голоду вконец погибли и разорены до основания».
Московским служилым людям позволялось брать в плен мещан в захваченных городах. Позже этих пленников продавали в рабство по цене от 3 до 6 рублей за «голову». Из наших городов вывозили в Московию квалифицированных ремесленников разных специальностей — оружейников, ствольников, пороховщиков, слесарей и токарей, Серебрянников, резчиков по дереву и кости, замочников, золотых дел мастеров, часовщиков, живописцев-иконописцев, печатников, кафельников и прочих. Из храмов увозили в Москву ценные иконы, церковные книги, другое имущество.
Московское командование часто прибегало к реквизициям, отбирая у крестьян коней и упряжь, запасы продуктов и фуража, самих крестьян насильно привлекало к военно-строительным и другим повинностям. Московские власти заставляли их продавать хлеб по низким ценам, а расплачивались медными деньгами, сильно упавшими в цене.