В отместку Зевсу, родившему Афину, Гера самостоятельно (без супруга) родила Гефеста, однако не совсем удачно – Гефест получился хилым и уродливым. Чтобы не мучить себя жалким зрелищем, какое являл собой ее сын, Гера сбросила его с Олимпа. Младенец упал в море, где к нему на помощь пришли Фетида и Эвринома; они поселили его в глубокой пещере, где он впоследствии построил свою первую кузницу и в благодарность за доброту изготовил для своих спасительниц множество украшений и более полезных вещей. Гефест долго таил в сердце гнев на свою мать и наконец решил отомстить ей. Он выковал золотой трон необыкновенной красоты и послал его Гере – та пришла в восторг от подарка, достойного царицы богов и людей. Однако стоило ей сесть на трон, как ее обвили несокрушимые путы, и Гера оказалась прикованной к трону, причем остальные боги были бессильны помочь ей. Все просьбы богов к Гефесту, срочно доставленному на Олимп, оказались тщетными, и, лишь когда хитроумный Дионис изрядно напоил его благовонным вином, охмелевший бог-кузнец забыл обиду и освободил свою мать. После этого Гефест остался жить на Олимпе. По другой версии, Гера увидела изготовленную Гефестом брошь на груди у Фетиды и поинтересовалась, где та достала такое сокровище. Увидев замешательство Фетиды, Гера настояла на том, чтобы та рассказала ей всю правду, и в тот же миг вернула Гефеста на Олимп. Так или иначе, Гера всячески старалась загладить свою вину перед сыном – она построила для него кузницу лучше прежней, где ни на миг не затухали двадцать горнов, и даже устроила его свадьбу с красавицей Афродитой.
Сыном Геры был также Арес – один из самых кровавых и стихийных богов. От прикосновения к земле Гера породила чудовище Тифона (по другой версии, Тифон появился от союза Геи и Тартара) с пятьюдесятью головами, которое доставило Зевсу много неприятностей, прежде чем тот смог испепелить его молниями и забросить подальше в Тартар.
Известна ненависть Геры к Гераклу – сыну Зевса и смертной женщины Алкмены. Чтобы поставить Геракла в зависимость от ничтожного Эврисфея, она приказала своей дочери Илифии, богине родов, ускорить роды Никиппы, матери Эврисфея, и задержать роды Алкмены, т. е. рождение Геракла (по другой версии Гера сделала это самостоятельно). Однако этот ее поступок привел к совершенно иным, нежели она рассчитывала, последствиям – Геракл, вынужденный служить Эврисфею, совершил благодаря этому свои великие подвиги. Злясь на мужа, Гера доставила Гераклу множество неприятностей: послала к его колыбели двух огромных змей, которых он, еще младенец, успешно задушил; наслала на него безумие, в припадке которого он убил своих детей; чинила ему козни и всячески препятствовала при совершении им своих подвигов. Однако в конце концов ей пришлось примириться с ним и даже отдать ему (уже как богу) в жены свою прекрасную дочь Гебу.
Охваченная ревностью, Гера коварно погубила Семелу, мать Диониса, зачатого ею от Зевса. Новорожденного Диониса по приказу Геры титаны разорвали на куски. Рея разыскала внука, вновь составила из кусков его тело и вернула к жизни, после чего Персефона, которой Зевс отныне поручил присматривать за ребенком, передала его царю Афаманту и его жене Ино, велев растить ребенка на женской половине дома, переодетым в девочку. Однако Геру не удалось обмануть, и она жестоко наказала царскую чету, наслав на Афаманта безумие, в припадке которого тот убил своего сына, приняв его за оленя. Спасаясь от Афаманта, Ино с другим сыном бросились в море и утонули. (Гера мстила Афаманту и Ино еще и потому, что Афамант ради Ино оставил свою первую жену, богиню облаков Нефелу, которая пожаловалась Гере, к тому же Ино коварно пыталась погубить Геллу и Фрикса, детей Нефелы.) Когда Дионис стал взрослым, Гера признала в нем сына Зевса и тоже вселила в него безумие; он отправился странствовать по свету в сопровождении дикой толпы сатиров и менад.
Опасаясь гнева ревнивой Геры, Зевс превратил свою возлюбленную Ио в белую корову. Гера потребовала ее себе в дар и приставила к ней стражем стоглазого Аргоса. Гермес, посланный Зевсом на выручку Ио, убил Аргоса, после чего неумолимая Гера наслала на Ио овода, который жалил ее и гнал по всему миру.
Гера помогала аргонавтам, прежде всего Ясону, потому что Пелий обидел ее, отказав в традиционной жертве, и богине захотелось наказать незаконно занявшего трон Иолка царя за небрежение. Предварительно она устроила проверку Ясону, приняв облик старухи, умоляющей прохожих перенести ее через поток, – никто не сжалился над ней, кроме Ясона, вежливо подставившего ей свою широкую спину. Когда аргонавты прибыли в Колхиду, Гера с Афиной попросили Афродиту, чтобы ее капризный малыш Эрот пробудил неожиданную страсть к Ясону в сердце дочери Ээта волшебницы Медеи.