Балтийские страны и Польша сразу забили тревогу. Они истолковали манёвры как предупреждение им из-за их военного участия в НАТО и потребовали от государств-членов НАТО дополнительных гарантий безопасности. В данной напряжённой ситуации Россия повела себя не очень разумно. Вскоре после учений последовали необдуманные высказывания российского министра обороны о возможном военном присутствии России для защиты Балтийского газопровода. Вдобавок российский Генштаб выразил свою готовность охранять от террористических актов не только сам газопровод, но и буровые вышки на побережье Калининграда, а также экспортные маршруты нефти в Балтийском море. Польша, Швеция и государства Балтии таким образом получили в свои руки аргументы, с помощью которых могли сорвать «Северный поток». Неоспорим тот факт, что русский военно-морской флот получил от «Газпрома» задание оказать содействие при очистке морского дна от мин времен Первой и Второй мировой войны вдоль участка строительства трубопровода. Из-за разногласий заказ по очистке балтийского дна перешел к частной британской фирме. Российский флот не получал никаких приказов относительно охраны «Северного потока».
Еще до начала учений Путин и Медведев подлили масла в огонь, угрожая в ответ на размещение элементов американской ПРО в Польше и Чехии разместить в Калининградской области защитные ракеты. Во времена холодной войны Калининградская область представляла собой чистой воды военный гарнизон и была полностью изолирована от внешнего мира. В Калининграде располагалась штаб-квартира Балтийского флота, а регион занимал позицию линии фронта по отношению к НАТО. В регионе размещалось более 100 тысяч солдат и морских пехотинцев. Там была высокоразвитая военная промышленность. После окончания холодной войны ситуация резко изменилась. Калининград стал отделенным от основной территории страны анклавом внутри ЕС, а российская армия была вынуждена испрашивать разрешение на полеты военной авиации и транспортировку оружия у Польши и Литвы. От военного бюджета России минувших лет осталась лишь бледная тень. Число наземных войск было сокращено на 85 %, вся тяжелая военная техника, включая авианосцы, миноносцы и подводные лодки, была оттуда выведена. По своей мощи Балтийский флот сравнялся с боевым флотом Германии и Швеции. Теперь в акватории Балтийского моря он по мощи в 10 раз уступал НАТО. Но и после реструктуризации российского военного бюджета Балтийским флотом пренебрегли. Россия расставила другие приоритеты и сначала взялась за модернизацию Черноморского флота. В Балтийском море не было угрозы конфликтов, и только ссора с США из-за размещения противовоздушных ракет привела к пополнению военного бюджета средствами на перевооружение Балтийского флота. Кроме того, в Калининградской области должны были открыться новые авиабазы и развернуться ракетные комплексы «Искандер». Сам собой напрашивался вопрос, не лучше ли было установить эти оборонительные системы на южных границах России?
Из-за своего особого географического положения Калининград стал чувствительным местом в европейской архитектуре безопасности. После того, как в конце 90-х годов ЕС проявил особый интерес к Калининграду, Москва отнеслась к этому с недоверием. Кремль беспокоил вопрос целостности региона, который многие уже называли «четвертой Балтийской республикой». Евросоюз проявлял интерес в отношении Калининграда, так как экономическая ситуация там постоянно ухудшалась, усиливалось влияние организованной преступности. При Путине экономическая ситуация в Калининграде улучшилась. Его теща была оттуда родом. Но регион так и не стал раем для инвесторов, как об этом было заявлено Кремлем. Когда наступил финансовый кризис, Кремль был вынужден сократить трансфертные платежи в Калининградскую область. Это повлекло за собой массовые протесты в регионе, которые пришлись на время финансового кризиса в стране. Впервые на улицах появились демонстранты с антипутинскими плакатами. Кремль испугался и снял с должности губернатора области.