Поставку башенных установок Ф.К. Авелан распределил следующим образом: Металлический завод выполнял их для эскадренных броненосцев “Андрей Первозванный” и “Чесма” и, совместно с Обуховским, — для “Иоанна Златоуста” и “Евстафия”, а Путиловский — для “Императора Павла I”. Последнее предприятие получило этот заказ только для поддержания деятельности его башенной мастерской. Стоимость двух башенных установок для первого корабля составляла 750 тыс. руб., для остальных — 710 тыс. руб. с установкой и сборкой. Кроме того, Металлический завод изготавливал все орудийные станки и минные аппараты, а Обуховский — орудийные стволы и отдельные поковки для башенных установок.
Однако вскоре, по опыту Русско-японской войны и вследствие значительной стоимости, перевооружение эскадренного броненосца “Чесма” признали нецелесообразным. Изготовление его новых башенных установок, имевших большой задел по объему выполненных работ, МТК и ГУКиС признали необходимым довести до конца. Их решили установить на “Иоанне Златоусте”, благо вносимые при этом конструктивные изменения оказались крайне незначительными. Совместная же поставка Металлическим и Обуховским заводами одного из двух комплектов установок, по которому работы замедлились, отменялась. Резолюция в этой связи морского министра вице-адмирала А.А. Бирилева, наложенная на документе 11 августа 1906 года, красноречиво гласит о его компетентности: “Не имея возможности входить в технические подробности, мне остается только согласиться с представлением, что я делаю, возлагая всю ответственность на комитет”.
В первое время строительство кораблей шло довольно быстрыми темпами, непривычными на Черном море, но затем они заметно ослабели. Так, если среднемесячная поставка стали, брони, дерева, систем и различных устройств на эскадренный броненосец “Евстафии” с начала постройки и до спуска на воду составляла 118,95 т, то после спуска и до 1 августа 1910 года она сократилась до 43,24 т. Одной из важнейших причин, но мнению главного корабельного инженера Севастопольского порта полковника Н.И. Янковского (до 19 марта 1907 года старший судостроитель), превративших создание этих кораблей в долгострой, явилось то, что "к постройке приступлсно без разработки и выяснения важнейших вопросов", относящихся к их вооружению и защите, а также то, что она совпала с Русско-японской войной.
Опыт последней заставил по-новому оценить основные боевые элементы и даже внутреннее расположение броненосцев, что вызвало множество предложений по изменению первоначального проекта".
Однако почти полностью сформированные к зтому времени корпуса кораблей уже не позволяли внести кардинальные нововведения в их конструкцию, но принятие ряда существенных поправок в проект позволило значительно улучшить тактико-технические элементы (ТТЭ) броненосцев. Наиболее же радикальным, способным значительно повысить боевые возможности кораблей, явилось бы воплощение в жизнь проекта А.Э.Шотта, разработанного летом 1905 года по рекомендации технической комиссии артиллерийских офицеров Севастопольского порта. Проект предусматривал замену всех двенадцати 152-мм орудий на батарейной палубе шестью 203-мм и доведение числа 75-мм до двадцати (существовал также вариант их замены пятью 120-мм орудиями). Однако на его реализацию, требовавшую больших переделок в корпусах и замедлявшую ход строительства, а также из-за опасения за возможную более чем 100-тонную перегрузку, МТК и командование Черноморского флота не решились.