Вековые отношения литовцев и немцев, о которых так много писал Видунас (Vydūnas)[9]
, во время последней войны были наиболее сложными. Не все немцы были нацистами и не все нацисты были немцами. Надо признать, что некоторые представители немецкого военного руководства выражали сочувствие к идее автономии Литвы: это командующий тыловым районом вермахта в Литве генерал пехоты Карл фон Рок, генерал-майор Э. Юст, подполковник Арно Кригсхейм[10] и др. Генерал К. фон Рок пошёл ещё дальше: весь поход на Россию называл «военным безумием», чинов зондеркоманд СС — «головорезами», а И. фон Риббентропа — «идиотом».Командующий тыловым районом вермахта в Литве генерал пехоты фон Рок (Karl von Roques)
разместил свою штаб-квартиру во временной литовской столице Каунасе. Доброе взаимопонимание генерала с литовскими властями вскоре было нарушено вмешательством СС, которые, руководствуясь директивами А. Гитлера, намеревались арестовать Временное правительство Литвы. Однако генералу удалось предотвратить насилие. Уже 17 июля 1941 г. К. фон Рок перенёс свою штаб-квартиру в Ригу и угроза вновь нависла над ВПЛ.Политические руководители Третьего рейха официально, de jure,
не признали ВПЛ, немецкий военный комендант генерал майор Роберт фон Поль отказывался разговаривать с её представителями. Немцы также требовали в официальной переписке и объявлениях не употреблять слов «Литовская республика», «независимость», «министры», кроме того, немцы ввели цензуру и другие ограничения, однако правительство И. Амбразявичюса сразу не ликвидировали, придав ему функции подсобного органа немецкого военного руководства. Деятельность ВПЛ велась на территории, подконтрольной немецкой группе армий «Север», Восточная Литва находилась в компетенции группы армий «Центр», поэтому для решения вопросов гражданского населения Вильнюса и поддержания связи с немецким военным командованием был создан упомянутый выше ГКВУГ во главе с доцентом Вильнюсского университета С. Жакявичюсом. До августа 1941 г. это был второй после правительства орган литовского самоуправления в Литве, организовавший свою деятельность согласно общим указаниям ВПЛ. Фактически оба эти органа литовского самоуправления были в непосредственном подчинении немецкой военной администрации: правительство — немецкому военному коменданту Каунаса, Комитет — немецкому военному коменданту Вильнюса.Первые несколько дней войны в Вильнюсе и Каунасе функции военной власти исполняли командиры соответствующих военных подразделений вермахта. Но вскоре были созданы немецкие военные полевые комендатуры (Feldkommandanturen):
749-я[11], 814-я — в Вильнюсе, 821-я[12] — в Каунасе. В их подчинении были срочно созданы местные комендатуры (Ortskommandamnturen). При военных полевых и местных комендатурах также действовала и немецкая полевая полиция (полевая жандармерия). Главное предназначение немецких военных комендатур было вместе с местной национальной полицией обеспечение порядка и безопасности на занятой территории.Таким образом, в Вильнюсе и Каунасе с соответствующими территориями действовали приказы и распоряжения одного содержания и был установлен одинаковый немецкий военный порядок управления. Немецким военным учреждениям были приданы все литовские полицейские органы как в Вильнюсе и в Восточной Литве, так и в Каунасе и в западных районах Литвы (включая Кайшядорский, Укмяргский, Утянский, Зарасайский уезды).
В некоторых уездах Литвы литовская полиция создавалась по распоряжению немецких властей. Так, в Лаздияй немецкий военный комендант 24 июня 1941 г. приказал организовать литовскую вспомогательную полицию{13}
. В Утянском, Зарасайском, Укмяргском, Рокишкском уездах коменданты вермахта утверждали численность и границы деятельности литовской полиции{14}.Части вермахта и вместе с ними прибывшие оперативные группы (SS Einsatzgruppe)
немецкой полиции безопасности и СД[13] старались подчинить себе вооруженные отряды литовцев, воссоздающуюся литовскую полицию безопасности и полицию общественного порядка и координировать их деятельность в нужном направлении. Прибывшая в Каунас оперативная команда 3/А (SS-Einsatzkommando 3/А) штандартенфюрера СС Карла Ягера (Karl Jäger) начала командовать местными вооруженными отрядами, а оперативная команда 9/Б (SS-Einsatzkommando 9/В) оберштурмбаннфюрера СС Освальда Шафера (dr. OswaldSchaefer) в июне 1941 г. в Вильнюсе забрала у вермахта под своё руководство созданную местным самоуправлением полицию.