Об авиаторах, с которыми работал в Иркутске, А. Е. Голованов сохранил добрые воспоминания и, если случалось, старался помочь, когда те оказывались в тяжёлом положении. Уже находясь на высоком посту командующего Авиацией дальнего действия (АДД) в годы Великой Отечественной войны, А. Е. Голованов получил замусоленный треугольник. На треугольнике стоял адрес: «Гражданину командующему Голованову». Писал ему А. В. Мансветов, бывший командир лётного отряда Восточно-Сибирского управления. Оказавшись на Колыме, он просил помочь восстановить справедливость. Голованов Мансветова хорошо знал. Голованов обратился непосредственно к Сталину с просьбой разрешить ему забрать Мансветова в АДД. Тот предложил написать официальное письмо в Народный комиссариат внутренних дел, что Голованов и сделал. Через несколько дней Мансветова освободили. Он отлично воевал.
Стоит учитывать, что представляло собой в то время Восточно-Сибирское управление. Рядом Китай, настоящий котёл политических партий и интриг. Сталин вмешивается в бурлящую политику региона, причём не открыто, а тайно, через Голованова. У него отличное прикрытие: он не военный, не агент НКВД, не дипломат, а обычный гражданский лётчик. Косвенные свидетельства тому – три монгольских боевых ордена, неафишируемые награды от Чан Кайши и Мао Цзэдуна.
За отличие в службе в период сражений на Халхин-Голе А. Е. Голованову был вручён орден Красного Знамени.
В 1937 году до Иркутска докатилась волна репрессий. Арестовали нескольких работников управления. Голованов, насколько это было в его силах, старался защитить людей от преследований или хотя бы смягчить обрушившуюся на них кару. Бывший заместитель начальника политотдела управления В. Бирюков, один из немногих, кому посчастливилось избежать последствий кровавых репрессий, вспоминал: «
Были подобные «друзья» и у Голованова, благодаря которым он оказался под угрозой ареста. В 1937 году вдруг был исключён из партии. А. Е. Голованов: «…
Там Александр Евгеньевич добился встречи с председателем Центральной контрольной комиссии ВКП(б) и доказал свою невиновность. В Центральной контрольной комиссии ВКП(б), сопоставив материалы «дела» об исключении Голованова из партии, за которым должен был следовать неминуемый арест, и представление лётчика к ордену Ленина за выдающиеся успехи в работе, приняли соломоново решение: в ордене отказали, а жизнь, свободу и членство в партии сохранили.
Правда, Голованова освободили от обязанностей начальника управления и назначили рядовым пилотом в Московское транспортное управление: сначала – пилотом 1-го класса 3-го авиатранспортного отряда Московского управления ГВФ, а затем – шеф-пилотом эскадрильи особого назначения (де-факто личным пилотом И. В. Сталина).
Перед войной шеф-пилот «Аэрофлота» А. Е. Голованов – орденоносец, его фото публикуется на обложке популярного журнала «Огонёк».
Также о Голованове известно, что он летал на личном самолёте Сталина, «Сталинском маршруте»: вывозил на нём сибирских, забайкальских и дальневосточных областных партийных, армейских и чекистских руководителей в Москву, где тех арестовывали прямо на аэродроме.
Шеф-пилот А. Е. Голованов
Аттестация
За период с 01.07.1938 по 01.08.1939 на пилота (1-го класса) 3-го авиатранспортного отряда МУ ГВФ ГОЛОВАНОВА А. Е.
Год рождения – 1904
Национальность – русский